| 337份小麦品种籽粒相关性状的全基因组关联分析 |
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| 引用本文： | 席甜甜,吴 倩,杨建光,马 新,陈彦竹,李 煜,王军卫,马守才.337份小麦品种籽粒相关性状的全基因组关联分析[J].麦类作物学报,2024(5):547-558. |
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| 作者姓名： | 席甜甜 吴 倩 杨建光 马 新 陈彦竹 李 煜 王军卫 马守才 |
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| 作者单位： | (西北农林科技大学农学院/小麦育种教育部工程研究中心/陕西省作物杂种优势研究与利用重点实验室，陕西杨凌 712100) |
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| 基金项目： | 陕西省重点研发计划项目（2023-YBNY-024;2023-YBNY-021）;陕西省作物杂种优势研究与利用重点实验室后补助项目（2018SZS-22）;西安市科技计划项目（23NYGG0021）;“两链”融合专项“小麦种业创新工程项目”（K3031222158） |
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| 摘 要： | 小麦籽粒大小和形态是决定产量的主要因素之一，挖掘籽粒相关性状的关联位点，筛选相关候选基因为提高小麦产量奠定了重要基础。本研究以337份小麦品种作为研究对象，利用Q+K混合线性模型(MLM)在3个环境(E1:2020年陕西杨凌；E2:2020年陕西斗口；E3:2021年陕西杨凌)下对小麦的千粒重、粒长、粒宽以及籽粒长宽比4个性状进行了全基因组关联分析(GWAS)。在3种环境中，不同小麦品种的4个籽粒性状都表现出了广泛的表型差异，变异系数为5.31%～14.76%,其中粒长的变异幅度最小，千粒重的变异幅度最大。GWAS结果表明，49个显著SNP位点至少在2个环境中被检测到，分布在除1B、4A和7D外的染色体上，解释了3.36%～12.73%的表型变异。检测到一因多效位点31个，在5A染色体上检测到3个环境下与3个籽粒性状(千粒重、粒长、粒宽)稳定相关的位点，表型贡献率为3.51%～7.74%。对稳定关联的SNP位点上下游各200 kb的物理区间内进行候选基因挖掘，筛选到5个(TraesCS2B01G225400、TraesCS4D01G016900、TraesCS5A01G454100、T...
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| 关 键 词： | 小麦 全基因组关联分析 籽粒性状 SNP 候选基因 |
Genome-Wide Association Studies of 337 Wheat Varieties for Grain-Related Traits |
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| XI Tiantian,WU Qian,YANG Jianguang,MA Xin,CHEN Yanzhu,LI Yu,WANG Junwei,MA Shoucai.Genome-Wide Association Studies of 337 Wheat Varieties for Grain-Related Traits[J].Journal of Triticeae Crops,2024(5):547-558. |
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| Authors: | XI Tiantian WU Qian YANG Jianguang MA Xin CHEN Yanzhu LI Yu WANG Junwei MA Shoucai |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Wheat Genome-wide association studies Grain traits SNP Candidate genes |
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