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鸭PPARα基因结构及功能的生物信息学分析
引用本文:马云,王云云,张晓婷,李芬,王启钊,王新庄.鸭PPARα基因结构及功能的生物信息学分析[J].浙江大学学报(农业与生命科学版),2011,37(4).
作者姓名:马云  王云云  张晓婷  李芬  王启钊  王新庄
作者单位:1. 信阳师范学院生命科学学院,河南信阳,464000
2. 信阳师范学院生命科学学院,河南信阳464000;华中科技大学生命科学与技术学院,湖北武汉430074
3. 信阳师范学院生命科学学院,河南信阳464000;浙江大学原子核农业科学研究所,浙江杭州310029
4. 河南农业大学牧医工程学院,河南郑州,450002
基金项目:河南省高等学校青年骨干教师资助计划资助项目,信阳师范学院青年基金计划资助项目
摘    要:以鸭的过氧化物酶体增殖物激活受体α(PPARα)基因为研究对象,运用生物信息学方法对其编码的蛋白质结构、理化性质及功能结构域进行分析.结果表明:鸭的PPARα基因cDNA全长1 430 bp,最长开放阅读框为1 407 bp,编码468个氨基酸;序列比对结果显示鸭的PPARα基因与鸡、胸草雀、人、牛、家马等该基因的核苷酸序列同源性分别为96%、92%、79%、77%和78%,鸭PPARα基因编码的氨基酸序列与上述其他动物的同源性高达98%、97%、89%、89%和88%;系统进化分析结果显示,在鸡、胸草雀、人、牛、马等动物中,鸭的PPARα基因与鸡的进化关系最为密切,亲缘关系最近;鸭的PPARα蛋白中α螺旋较多,该蛋白质含有1段短的核定位信号序列KKNRNKC,在引导该蛋白质进入细胞核的过程中发挥作用,同时还有由2个锌指结构组成的DNA结合域及1段配体结合域.

关 键 词:  过氧化物酶体增殖物激活受体α(PPARα)基因  生物信息学分析
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