| 猪圆环病毒(PCV)序列分析与进化 |
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| 引用本文： | 马相如,陈焕春,肖少波,刘正飞,曹胜波,张利达.猪圆环病毒(PCV)序列分析与进化[J].中国兽医学报,2004,24(2):105-108. |
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| 作者姓名： | 马相如 陈焕春 肖少波 刘正飞 曹胜波 张利达 |
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| 作者单位： | 华中农业大学,畜牧兽医学院,湖北,武汉,430070 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目 (3 0 170 70 1) |
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| 摘 要： | 从 Gen Bank数据库下载了世界各地分离的猪圆环病毒基因组全序列 ,并对其进行多重比对 ,绘制系统进化树 ,发现来自同一国家或地区的 PCV毒株亲缘关系较近。提取 PCV ORF1编码的蛋白质序列 ,进行多序列比较 ,分析保守氨基酸序列 ,搜索结构域相似序列 ,结果发现玉米线条病毒属与 PCV的起源有密切的关系。此外 ,在数据处理过程中通过自编程序结合互联网及免费软件 ,能迅速进行大规模序列比较分析 (35个序列以上 ) ,提高了生物数据分析处理的速度。
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| 关 键 词： | 猪圆环病毒 序列分析 系统进化 生物信息学 |
| 文章编号： | 1005-4545(2004)02-0105-04 |
| 修稿时间： | 2003年1月16日 |
Sequence Analysis and Evolution Studies on Porcine Circovirus Genome |
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| MA Xiang-ru,CHEN Huan-chun,XIAO Shao-bo,LIU Zheng-fei,CAO Sheng-bo,ZHANG Li-da.Sequence Analysis and Evolution Studies on Porcine Circovirus Genome[J].Chinese Journal of Veterinary Science,2004,24(2):105-108. |
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| Authors: | MA Xiang-ru CHEN Huan-chun XIAO Shao-bo LIU Zheng-fei CAO Sheng-bo ZHANG Li-da |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | porcine circovirus(PCV) sequence analysis evolution bioinformatics |
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