| 肉鸡H9N2亚型禽流感病毒全基因测序及遗传进化分析 |
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| 引用本文： | 万春和,傅光华,程龙飞,施少华,陈红梅,林芳,林建生,黄瑜.肉鸡H9N2亚型禽流感病毒全基因测序及遗传进化分析[J].农业生物技术学报,2009,17(5):750-757. |
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| 作者姓名： | 万春和 傅光华 程龙飞 施少华 陈红梅 林芳 林建生 黄瑜 |
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| 作者单位： | 福建省农业科学院畜牧兽医研究所,福州,350013 |
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| 基金项目： | 国家重点基础研究规划(973)项目 |
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| 摘 要： | 根据GenBank登陆的H9N2亚型禽流感病毒（AIV）的全基因序列，设计11对引物，运用RT-PCR方法扩增A／Chicken／Zhejiang／HJ／2007(H9N2)毒株8个基因片段，并克隆到pMD18-T载体中进行序列测定。基因序列比较及遗传进化分析结果表明，所克隆的8个基因片段均有HJ毒株完整的开放阅读框（ORF），其血凝素（HA）基因蛋白裂解位点的氨基酸组成为-PSKSSR*G-，为不连续的碱性氨基酸，符合低致病性AIV HA基因裂解位点的序列特征；与QA/HK/G1/97的进化关系较近，处在同一分支。其神经氨酸酶（NA）基因在63、64、65位点上有3个氨基酸（T、E、I）缺失，在遗传进化上属于常见的CK/BJ/1/94（DK/HK/Y280/97）群系。核蛋白（NP）基因整合有同地分离的H5N1亚型流感病毒NP基因片段，进化关系较近。基质蛋白（M）基因与1999年香港感染儿童的两株流感病毒（HK/1073/99和HK/1074/99）进化关系属于同一分支。非结构蛋白（NS）基因与近年来分离的猪源H9N2亚型流感病毒进化关系相近，和1998年首次报道的猪源H9N2亚型流感病毒（SW/HK/9/98）处在同一进化分支。聚合酶蛋白（PA、PB2、PB1）中，PB1从33-47位存在15个连续碱基缺失，是首次报道该基因ORF内存在缺失，从遗传进化上和近年来分离的H5N1亚型流感病毒处在同一分支上；PA基因从遗传进化上和PB1基因类似；PB2基因与常见的流感病毒毒株的遗传进化关系较远，在相应的进化树另成分支。因此，A／Chicken／Zhejiang／HJ／2007(H9N2)是由不同流感病毒基因亚系间发生自然重排的产物。
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| 关 键 词： | H9N2亚型禽流感病毒 基因重组 进化分析 |
| 收稿时间： | 2008-11-12 |
| 修稿时间： | 2009-1-14 |
Sequencing of the Eight Genes of A/Chicken/Zhejiang/HJ/2007 (H9N2) Subtype avian influenza virus and Their Phylogenetic Analysis WAN Chun-he, FU Guang-hua, CHENG Long-fei, SHI Shao-hua, |
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| WAN Chun-he,FU Guang-hua,CHENG Long-fei,SHI Shao-hua,CHEN Hong-mei,LIN Fang,LIN Jian-sheng,HUANG Yu.Sequencing of the Eight Genes of A/Chicken/Zhejiang/HJ/2007 (H9N2) Subtype avian influenza virus and Their Phylogenetic Analysis WAN Chun-he, FU Guang-hua, CHENG Long-fei, SHI Shao-hua,[J].Journal of Agricultural Biotechnology,2009,17(5):750-757. |
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| Authors: | WAN Chun-he FU Guang-hua CHENG Long-fei SHI Shao-hua CHEN Hong-mei LIN Fang LIN Jian-sheng HUANG Yu |
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| Institution: | WAN Chun-he,FU Guang-hua,CHENG Long-fei,SHI Shao-hua,CHEN Hong-mei,LIN Fang,LIN Jian-sheng,HUANG Yu(Institute of Animal Husbandry and Veterinary Medicine,Fujian Academy of Agricultural Sciences,Fuzhou 350013,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | H9N2 subtype AIV phylogenetic analysis gene reassortment |
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