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黄鳝csf1r基因的克隆及时空表达特征分析
引用本文:仲旭晴,阮 瑞,李勇智,等.黄鳝csf1r基因的克隆及时空表达特征分析[J].西北农林科技大学学报(社会科学版),2024,52(2):51-59.
作者姓名:仲旭晴  阮 瑞  李勇智  
作者单位:上海海洋大学 水产与生命学院;中国水产科学研究院 长江水产研究所 农业农村部淡水生物多样性保护重点实验室
基金项目:国家自然科学基金项目(31702395)
摘    要:【目的】克隆黄鳝csf1r基因,并对其时空表达特性进行分析,为探明csf1r基因在黄鳝不同体色形成中的作用奠定基础。【方法】采用RACEs(Rapid-amplification of cDNA ends)技术从黄鳝皮肤cDNAs中克隆得到csf1r基因的全长cDNA序列,对其编码蛋白进行生物信息学分析。采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)方法检测csf1r基因在黄鳝不同组织、不同发育时期胚胎或个体及3种体色黄鳝(黄黑斑鳝、碎花斑鳝和隐花斑鳝)皮肤和肾脏中的相对表达量,分析该基因的表达特征。测定3种体色黄鳝肝脏中的碱性磷酸酶(AKP)、超氧化物歧化酶(SOD)活性和总抗氧化能力(T-AOC)。【结果】黄鳝csf1r cDNA序列全长为4 430 bp(GenBank收录号:OP589303),其编码区长度为2 937 bp,编码978个氨基酸,存在免疫球蛋白结构域和蛋白激酶催化结构域2个保守结构域。荧光定量PCR结果表明,csf1r基因在黄鳝脑、精巢、卵巢、肠、心脏、肾脏、肝脏、肌肉、皮肤和脾脏等组织中均有表达,在脾脏和心脏中表达量较高,其次是肾脏、皮肤和肌肉,卵巢中表达量最低;csf1r在胚胎眼晶体形成期开始大量表达,显微观察发现该时期胚胎的躯干上开始有色素颗粒出现。在3种体色黄鳝皮肤和肾脏中,csf1r基因在黄黑斑鳝的皮肤中表达量最低,而在其肾脏中表达量最高。3种体色黄鳝肝脏氧化应激指标测定结果发现,黄黑斑鳝肝脏中的碱性磷酸酶(AKP)、超氧化物歧化酶(SOD)活性和总抗氧化能力比其他2种体色黄鳝高,但是差异未达显著水平。【结论】csf1r基因可能不仅参与了黄鳝体色的形成,还与黄鳝非特异性免疫相关。

关 键 词:黄鳝  csf1r  时空表达分析  体色
收稿时间:2022/11/29 0:00:00

Cloning and spatio-temporal expression pattern of csf1r gene in Monopterus albus
ZHONG Xuqing,RUAN Rui,LI Yongzhi,et al.Cloning and spatio-temporal expression pattern of csf1r gene in Monopterus albus[J].Journal of Northwest Sci-Tech Univ of Agr and,2024,52(2):51-59.
Authors:ZHONG Xuqing  RUAN Rui  LI Yongzhi  
Abstract:
Keywords:Monopterus albus  csf1r  spatio-temporal expression  body color
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