| 苹果茎沟病毒外壳蛋白基因的克隆、表达及其生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 王 潇,韩秀清,成思琼,郝兴安.苹果茎沟病毒外壳蛋白基因的克隆、表达及其生物信息学分析[J].陕西农业科学,2020,66(4):4-8. |
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| 作者姓名： | 王 潇 韩秀清 成思琼 郝兴安 |
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| 作者单位： | （1.西北农林科技大学，陕西 杨凌 712100；2. 陕西新世界果业集团有限公司，陕西 杨凌 712100) |
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| 基金项目： | 陕西省重点研发计划（No. 2018ZDXM-NY-003），国家重点研发计划（2018YFD0201404）。 |
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| 摘 要： | 从中国苹果寄主上分离苹果茎沟病毒(Apple Stem Grooving Virus,ASGV),克隆并表达外壳蛋白(Coat Protein, CP)基因,并进行生物信息学分析。利用RT-PCR从苹果寄主上克隆了苹果茎沟病毒外壳蛋白基因,序列测定后构建了原核表达载体pET30a(+),转化大肠杆菌(Escherichia coli)进行原核表达。分析比较苹果茎沟病毒外壳蛋白基因核酸序列,分析并预测苹果茎沟病毒外壳蛋白的结构和性质。克隆,表达了苹果茎沟病毒外壳蛋白基因。序列分析显示本研究ASGV CP开放阅读框(Open Reading Frame, ORF)全长714个核苷酸,与其他分离物CP基因核酸同源率为88.80%～91.90%,与来自日本苹果的P-209进化关系最近。ASGV CP是由237个氨基酸残基组成的27.13 kD蛋白,等电点PI为7.67的疏水性,非跨膜蛋白。二级结构由7个α-螺旋,5个β-片层和无规则卷曲构成。三级结构由于缺少同源蛋白而无法预测。本研究成功诱导表达了ASGV-CP蛋白,分析了ASGV-CP的核酸序列和进化关系,蛋白性质和蛋白结构,为进一步的功能研究和检测应用奠定了基础。
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| 关 键 词： | 苹果茎沟病毒 外壳蛋白基因 序列分析 生物信息学分析 |
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