西藏牦牛ELOVL6基因的克隆、生物信息学及组织表达量分析 |
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引用本文: | 任稳稳,郑青波,黄纯,王兴东,阎萍,梁春年.西藏牦牛ELOVL6基因的克隆、生物信息学及组织表达量分析[J].黑龙江畜牧兽医,2022(18):130-135+140+145. |
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作者姓名: | 任稳稳 郑青波 黄纯 王兴东 阎萍 梁春年 |
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作者单位: | 1. 西北民族大学生命科学与工程学院;2. 中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所甘肃省牦牛繁育工程重点实验室;3. 农业农村部青藏高原畜禽遗传育种重点实验室 |
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基金项目: | 财政部和农业农村部-现代农业(肉牛牦牛)产业技术体系建设专项(CARS-37);;甘肃省科技计划资助项目(20JR5RA580); |
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摘 要: | 为探究西藏牦牛ELOVL6基因的结构与功能,试验采用PCR技术克隆西藏牦牛ELOVL6基因编码区序列,利用在线软件预测和分析其编码氨基酸序列的生物信息学特征,并利用实时荧光定量PCR技术测定ELOVL6基因在西藏牦牛不同组织中的表达水平。结果表明:西藏牦牛ELOVL6基因编码区序列长度为795 bp,共编码264个氨基酸;与牛ELOVL6基因(GenBank登录号为NM_001102155.1)编码的氨基酸序列比较,其第18位核苷酸位点发生了碱基突变(A→C)。西藏牦牛与普通牛亲缘关系较近,与斑马鱼亲缘关系较远。ELOVL6基因编码蛋白是一种主要在内质网发挥生物学功能的疏水性蛋白,共有20个磷酸化位点,有跨膜结构,无信号肽,二级结构以α-螺旋为主。ELOVL6基因在西藏牦牛的不同组织中均有表达,其中,在脂肪组织中的相对表达量最高,极显著高于其他组织(P<0.01)。说明ELOVL6基因可能是调控牦牛脂肪酸代谢的关键基因。
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关 键 词: | 西藏牦牛 ELOVL6基因 克隆 生物信息学 组织表达分析 |
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