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基于16S rRNA测序分析巴马小型猪性别与肠道微生物的关系
引用本文:曹东,辛金鸽,曾燕,倪学勤.基于16S rRNA测序分析巴马小型猪性别与肠道微生物的关系[J].黑龙江畜牧兽医,2022(23):115-120+137-138.
作者姓名:曹东  辛金鸽  曾燕  倪学勤
作者单位:四川农业大学动物医学院
摘    要:为了研究性别对巴马小型猪粪便微生物组成及丰度的影响,试验以10头雄性和10头雌性试验用巴马小型猪作为试验对象,收集新鲜粪便,采用16S rRNA测序技术和生物信息学分析方法,分析微生物多样性、组成并对预测的代谢通路进行了差异分析。结果表明:雄性巴马小型猪和雌性巴马小型猪之间微生物的Alpha多样性无显著差异(P>0.05)。在门水平上雄性和雌性巴马小型猪的核心菌群均为厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes);在属水平上雄性的核心菌群为志贺氏杆菌属(Shigella,5.81%)、颤螺菌属(Oscillospira,4.62%)、密螺旋体属(Treponema,4.14%)、梭菌属(Clostridiaceae_Clostridium,2.73%)及拟杆菌属(Bacteroides,2.58%),雌性为颤螺菌属(5.23%)、密螺旋体属(4.94%)、链球菌属(Streptococcus,3.74%)、SMB53(2.35%)及梭菌属(2.12%)。在门水平上,雌性疣微菌门(Verrucomicrobia)的丰度显著高于雄性(P<0.05);在...

关 键 词:巴马小型猪  性别  肠道微生物  16S  rRNA测序  多样性
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