| 国内新型鸭肝炎病毒基因组3′末端的序列特点 |
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| 引用本文： | 潘梦,付余,王笑言,徐永亮,杨汉春,张大丙.国内新型鸭肝炎病毒基因组3′末端的序列特点[J].中国农业大学学报,2008,13(4). |
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| 作者姓名： | 潘梦 付余 王笑言 徐永亮 杨汉春 张大丙 |
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| 作者单位： | 中国农业大学动物医学院／农业部预防兽医学重点开放实验室,北京100193 |
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| 摘 要： | 为揭示国内新型鸭肝炎病毒（DHV）基因组3′末端的序列特点,用3′RACE和RT-PCR克隆DHV分离株C-GY株的基因组3′末端序列,并以GenBank中已知全序列的22株DHV作为参照,进行比较分析。结果表明,C-GY株基因组3′末端包含1 359 nt的3D、终止密码子TAA3、66 nt的3′UTR和15 nt的poly（A）。与其他DHV相同之处：C-GY的3D蛋白含453个氨基酸,亦包含小RNA病毒RNA聚合酶的5个特征基序。C-GY的3′UTR长度与台湾新型DHV相同,仅比韩国新型缺少1个C,但比DHV血清1型（DHV-1）长52 nt。分析3D和3′UTR核苷酸序列,可见C-GY与16株DHV-1之间同源性为75%～77%和66%～68%、与2株台湾新型DHV之间为80%和91%、与4株韩国新型之间为96%～97%和96%～97%,表明C-GY与韩国新型DHV具有相近的遗传关系,C-GY株与本实验中参考DHV属于小RNA病毒科的同一个未命名的新属,而且C-GY属于DHV的基因C型,也说明新型DHV与DHV-1的基因组3′末端存在较高的序列变异性。
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| 关 键 词： | 鸭肝炎病毒 新血清型 基因型 3D基因 3′非翻译区 |
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