贵州草海鲫鱼HIF-1α和HIF-2α基因克隆与表达分析 |
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引用本文: | 李青,葛传龙,欧阳力剑,金志梅,杨钦.贵州草海鲫鱼HIF-1α和HIF-2α基因克隆与表达分析[J].江苏农业科学,2022(17):31-38. |
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作者姓名: | 李青 葛传龙 欧阳力剑 金志梅 杨钦 |
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作者单位: | 1. 贵州省典型高原湿地生态保护与修复重点实验室;2. 贵州工程应用技术学院生态工程学院 |
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摘 要: | 为研究鲫鱼中HIF不同亚型基因的结构与生物学功能,克隆获得鲫鱼中HIF同源基因的2种亚型,分别命名为Ca-HIF1α和Ca-HIF2α。其中,Ca-HIF1α cDNA全长共3 867 bp,开放阅读框2 322 bp,编码774个氨基酸。Ca-HIF2α cDNA全长共4 647 bp,开放阅读框2 460 bp,编码820个氨基酸。预测蛋白质的分子质量分别为85.844、91.228 ku,等电点分别为5.12和6.20。SMART分析结果可知,二者具有HLH、PAS和PAC结构域,此外,多序列比对结果显示二者还具有ODD、N-TAD和C-TAD功能域。进化树结构表明,Ca-HIF2α比Ca-HIF1α进化得要快。实时荧光定量PCR结果显示,Ca-HIF2α mRNA在所检测组织中的相对表达量均高于Ca-HIF1α mRNA的表达量。此外,Ca-HIF1α和Ca-HIF2α mRNA在肝脏和鳃的相对表达量最高。
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关 键 词: | 鲫鱼 HIF1α基因 HIF2α基因 组织表达 生物学功能 |
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