| 阳春砂花丝、花柱转录组测序及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 杨博涵,徐杰,汤丽云,苏景,李子翔,何国振.阳春砂花丝、花柱转录组测序及生物信息学分析[J].江苏农业科学,2022(22):38-45. |
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| 作者姓名： | 杨博涵 徐杰 汤丽云 苏景 李子翔 何国振 |
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| 作者单位： | 1. 广州中医药大学中药学院;2. 广东一方制药有限公司/广东省中药配方颗粒企业重点实验室;3. 华南农业大学生命科学学院 |
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| 基金项目： | 广东省重点领域研发计划“现代种业”重大专项(编号：2020B020221002)； |
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| 摘 要： | 为进一步探究阳春砂假合蕊柱形成机制，基于RNA-Seq技术对不同生长时期阳春砂花丝、花柱进行转录组测序及生物信息学分析，获得阳春砂转录组数据并筛选出激素合成及信号转导通路基因，为后续研究阳春砂基因功能、代谢途径、花器官发育及运动调控机理等方面提供参考。结果表明，测序数据拼接组装后获得94 584条Unigene,总长度为92 501 015 bp。将获得的Unigene分别在NR、GO、KOG和KEGG等七大数据库中进行比对，共有62 174条Unigene得到注释，占全部Unigene的65.73%;NR数据库中注释到58 669条Unigene,被注释的同源序列主要来自于小果野芭蕉；有45 892条Unigene注释到KOG数据库中，涉及25个功能分类；GO数据库注释Unigene 12 050条，按照功能分为3个大类及55个亚类；KEGG数据库中，有44 000条Unigene注释到137个代谢通路中；SSR特征分析中共检测到18 895个位点，三碱基重复的数目最多，达到6 313个，占比为33.41%。2012条Unigene被注释到9种不同激素的合成与信号转导途径中，赤霉素的...
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| 关 键 词： | 阳春砂(Amomum villosum) 转录组 花丝 花柱 激素 |
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