| H5N1型禽流感病毒HA基因克隆及序列分析 |
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| 引用本文： | 申 燕,高冬妮,安 琦,刘 颖,葛菁萍,平文祥.H5N1型禽流感病毒HA基因克隆及序列分析[J].中国农学通报,2015,31(14):32-38. |
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| 作者姓名： | 申 燕 高冬妮 安 琦 刘 颖 葛菁萍 平文祥 |
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| 作者单位： | 黑龙江大学生命科学学院/微生物省高校重点实验室,黑龙江大学生命科学学院/微生物省高校重点实验室,黑龙江大学生命科学学院/微生物省高校重点实验室,黑龙江大学生命科学学院/微生物省高校重点实验室,黑龙江大学生命科学学院/微生物省高校重点实验室,黑龙江大学生命科学学院/微生物省高校重点实验室 |
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| 基金项目： | 基金项目：国家自然科学基金“表达IBDV主要保护性抗原的重组杆状病毒构建及其作为疫苗的免疫效果研究”(31270143)；国家自然科学基金“菌群演替与温水沤麻系统关键酶产生菌代谢组学特征的耦合机制”(31270534)；黑龙江省高等学校科技创新团队“农业微生物发酵技术”(2012td009)；黑龙江大学高层次人才（创新团队）支持计划“功能微生物选育及其产物应用”(Hdtd2010-17)。 |
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| 摘 要： | 为从分子生物学角度进一步研究H5N1型禽流感主要抗原HA基因,探究H5N1HA基因的遗传变异情况及其蛋白结构,根据GenBank中登录的H5N1型禽流感HA基因的序列利用Primer5.0设计引物扩增HA基因,将其克隆到pMD18-T载体后进行鉴定,对鉴定正确的重组质粒pMD-H5N1-HA进行测序分析。应用生物信息学软件对禽流感病毒HA基因进行系统进化树分析、氨基酸序列同源性分析、保守区分析,磷酸化位点和序列重复区分析及HA蛋白二级、三级结构的预测。核苷酸序列测定结果表明:HA基因长1661bp,共编码326个氨基酸;生物信息学分析结果表明:HA基因在种间具有较高保守性,HA基因的氨基酸序列与其他地方性禽流感H5N1病毒株HA基因的序列同源性最高可达99.7%,且为高致病性毒株;HA蛋白的二级、三级结构预测结果显示:HA蛋白多为α螺旋和β转角结构,无规则卷曲,是亲水性蛋白。该结果为禽流感病毒的分子病毒学研究奠定了基础。
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| 关 键 词： | 禽流感病毒 HA基因 序列分析 蛋白结构预测 |
| 收稿时间： | 2014/12/18 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2015/2/14 0:00:00 |
Cloning and Sequence Analysis of HA Gene of H5N1 Avian Influenza Virus |
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| Shen Yan,Gao Dongni,An Qi,Liu Ying,Ge Jingping and Ping Wenxiang.Cloning and Sequence Analysis of HA Gene of H5N1 Avian Influenza Virus[J].Chinese Agricultural Science Bulletin,2015,31(14):32-38. |
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| Authors: | Shen Yan Gao Dongni An Qi Liu Ying Ge Jingping and Ping Wenxiang |
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| Institution: | College of Life Science, Heilongjiang University/Key Laboratory of Microbiology,College of Life Science, Heilongjiang University/Key Laboratory of Microbiology,College of Life Science, Heilongjiang University/Key Laboratory of Microbiology,College of Life Science, Heilongjiang University/Key Laboratory of Microbiology,College of Life Science, Heilongjiang University/Key Laboratory of Microbiology,College of Life Science, Heilongjiang University/Key Laboratory of Microbiology |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | avian influenza virus HA gene sequence analysis protein structure prediction |
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