| 采用PCR-DGGE技术分析瘤胃菌群在不同纤维素富集条件下的多样性 |
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| 引用本文： | 曾燕,孙朋,倪学勤,杨杰,曾东,张洪瑜.采用PCR-DGGE技术分析瘤胃菌群在不同纤维素富集条件下的多样性[J].动物营养学报,2013(9):2136-2142. |
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| 作者姓名： | 曾燕 孙朋 倪学勤 杨杰 曾东 张洪瑜 |
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| 作者单位： | 四川农业大学动物医学院;动物疫病与人类健康四川省重点实验室 |
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| 基金项目： | 教育部留学回国人员科研启动基金资助;教育部长江学者和创新团队发展计划(IRT0848);四川农业大学大学生科研兴趣项目 |
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| 摘 要： | 本试验旨在采用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术分析瘤胃菌群在不同纤维素富集条件下的多样性。试验采用羧甲基纤维素(CMC)培养基、蛋白胨纤维素(PCS)培养基、J培养基和K培养基分别在37和50℃条件下培养瘤胃内容物,使用PCR-DGGE技术、DGGE图谱共性及特异性条带的克隆和测序、聚类分析和主成分分析(PCA)几种方法分析瘤胃菌群多样性。结果表明:37℃条件下,不同培养基的DGGE图谱差异较大,J培养基和PCS培养基间的相似性系数为0.77;J培养基和CMC培养基间的相似性系数仅为0.76。50℃条件下不同培养基的DGGE图谱相似性较高,J培养基和PCS培养基间的相似性系数为0.78;而CMC培养基和PCS培养基间的相似性系数高达0.84。DGGE图谱中共性条带属于解没食子酸链球菌和解脲芽孢杆菌2个菌属,是瘤胃中的优势菌群;而主要的特异性条带属于解没食子酸链球菌、摩氏假单胞菌、产碱杆菌和未培养毛螺旋菌4个菌属。结果提示,不同纤维素富集培养基和温度对瘤胃菌群的多样性有一定程度上的影响。
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| 关 键 词： | 瘤胃菌群 纤维素 PCR-DGGE 聚类分析 主成分分析 |
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