蓖麻RcDELLA基因的克隆及序列分析 |
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引用本文: | 李威,李国瑞,黄凤兰,丛安琪,李晓晨,白英俊,李孟建,陈永胜.蓖麻RcDELLA基因的克隆及序列分析[J].华北农学报,2018(1). |
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作者姓名: | 李威 李国瑞 黄凤兰 丛安琪 李晓晨 白英俊 李孟建 陈永胜 |
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作者单位: | 内蒙古民族大学;内蒙古自治区高校蓖麻产业工程技术研究中心;内蒙古自治区蓖麻育种重点实验室;内蒙古自治区蓖麻产业协同创新培育中心; |
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摘 要: | DELLA家族蛋白是植物GA信号途径的重要阻遏蛋白,能抑制植物的生长和发育,使植株产生矮化的表型。为了明确DELLA基因在蓖麻中的作用和功能,对RcDELLA基因进行生物学信息分析。以蓖麻2129六叶期茎尖的cDNA为模板,根据NCBI公布的DELLA(XM_002533984.2)蛋白基因片段设计引物,克隆该基因,并对其进行生物信息学分析。克隆得到该基因的完整阅读框,该基因编码序列全长为1 701 bp,编码567个氨基酸,推测其分子量为62 550.40 ku,等电点为5.14。二级结构预测表明α-螺旋占40.4%,β-折叠占8.6%,无规则卷曲占51.0%。系统进化树结果表明,RcDELLA先与大戟科巴西橡胶树和麻疯树形成分支。通过PCR扩增得到了RcDELLA基因的完整阅读框,同源性比对结果显示,RcDELLA具有典型的DELLA结构域,与NCBI上公布的其他植物的DELLA蛋白序列具有高度的同源性。系统进化树结果显示,与麻疯树亲缘关系最近,符合进化关系。生物信息学分析将为进一步研究DELLA基因在蓖麻矮化过程中的作用和功能奠定理论基础。
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