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富集培养的低温纤维素降解细菌菌群结构分析
引用本文:孟建宇,樊兆阳,李蘅,陶羽,王瑞刚,冯福应.富集培养的低温纤维素降解细菌菌群结构分析[J].农业生物技术学报,2014(5).
作者姓名:孟建宇  樊兆阳  李蘅  陶羽  王瑞刚  冯福应
作者单位:内蒙古农业大学生命科学学院应用与环境微生物研究所;
基金项目:国家自然科学基金项目(No.30860015);内蒙古自治区自然科学基金项目(No.2009ZD03和No.2010BS0506);内蒙古自治区高等学校科学研究项目(No.NJ10054);内蒙古农业大学创新团队项目(No.NDPYTD2010-3);内蒙古自治区高等学校青年科技英才支持计划
摘    要:内蒙古大兴安岭森林土壤中低温纤维素降解菌资源丰富,本研究旨在分析其菌群结构。在10℃下,用羧甲基纤维素钠(CMC-Na)培养基对样品中的低温纤维素降解菌进行富集传代培养,用3,5-二硝基水杨酸(DNS)法测定纤维素酶活性,以细菌16S rDNA通用引物(34lF和907R)进行V3~V5区域PCR扩增,以变性梯度凝胶电泳(DGGE)对PCR产物进行电泳,获得16S rDNA指纹图谱后分析细菌菌群结构。研究结果表明,低温富集传代过程中,相对酶活随着培养代数的增加而不断增加,第4代的相对酶活最高,为30.625 IU;每代都有菌种的消失和增加;富集培养液中包含属于α-变形菌纲(α-Proteobacteria)、β-变形菌纲(β-Proteobacteria)、γ-变形菌纲(γ-Proteobacteria)、硬壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes)类群的细菌,其中硬壁菌门类群(65.5%)和β-变形菌纲类群(13.8%)的细菌为优势菌。本研究证实,内蒙古大兴安岭森林土壤有丰富的低温纤维素降解菌资源,有潜在的应用前景。

关 键 词:低温纤维素降解菌  富集培养  群落结构  变性梯度凝胶电泳(DGGE)
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