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天祝白牦牛金属硫蛋白基因(MT-1)全序列分子克隆及生物信息学分析
引用本文:王雪莹,姬菩忠,马琦.天祝白牦牛金属硫蛋白基因(MT-1)全序列分子克隆及生物信息学分析[J].农业生物技术学报,2014(7).
作者姓名:王雪莹  姬菩忠  马琦
作者单位:甘肃农业大学动物医学院;兰州军区总医院;甘肃农业大学生命科学技术学院;
基金项目:甘肃省自然科学基金(No.1010RJZA154);甘肃省教育厅科研项目(No.0902-05)
摘    要:金属硫蛋白-1基因(metallothionein-1,MT-1)是一类广泛存在于动物体内的金属结合蛋白,除维持金属动态平衡和重金属解毒外,还可参与清除自由基、拮抗电离辐射和抗应激等。为深入研究MT-1基因参与动物机体抗逆性的分子机制,本研究采用RT-PCR和RACE(rapid amplification of cDNA ends,RACE)技术获得天祝白牦牛(Bos grunneins)MT-1基因全长cDNA序列,运用生物信息学方法分析MT-1蛋白的理化性质、结构和不同物种间的同源性,并利用RT-qPCR方法分析MT-1基因在天祝白牦牛各个脏器和组织中的表达丰度。结果表明,天祝白牦牛MT-1基因cDNA序列全长为408 bp(GenBank登录号:KF770836),开放阅读框(ORF)长186 bp,编码61个氨基酸,氨基酸的分子量为5.981 kD;氨基酸序列分析显示,天祝白牦牛MT-1基因编码氨基酸序列与牛(Bos taurus)的同源性高达100%,同时与大多数哺乳动物相似;荧光定量PCR结果发现,MT-1 mRNA在天祝白牦牛8个不同脏器和组织中均有表达,心脏中表达量最高。天祝白牦牛MT-1基因的成功克隆为进一步研究该基因的功能提供了基础资料。

关 键 词:金属硫蛋白  天祝白牦牛  RACE  生物信息学分析
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