| 石斑鱼PPAR-δ基因SNP位点和单倍型与抗虹彩病毒和神经坏死病毒抗性的关联 |
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| 引用本文： | 黄健玲,杨子敏,王雨欣,李鑫帅,刘翠瑜,陈锦鹏,秦启伟,杨敏.石斑鱼PPAR-δ基因SNP位点和单倍型与抗虹彩病毒和神经坏死病毒抗性的关联[J].华南农业大学学报,2023,44(3):391-401. |
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| 作者姓名： | 黄健玲 杨子敏 王雨欣 李鑫帅 刘翠瑜 陈锦鹏 秦启伟 杨敏 |
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| 作者单位： | 海洋生物资源保护与利用粤港澳高校联合实验室/华南农业大学 海洋学院, 广东 广州 510642 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(U20A20102，311021006)；广东省自然科学基金(2019A1515011747)；南方海洋科学与工程广东实验室珠海实验室创新群项目(311021006)；中国农业科学研究体系(CARS-47-G16) |
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| 摘 要： | 【目的】获得石斑鱼Epinephelus spp.抗病分子标记，选育石斑鱼抗病品系以解决石斑鱼病害频发的问题。【方法】基于免疫基因PPAR-δ的基因组DNA序列开展单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)位点筛选，并对这些位点分别进行石斑鱼虹彩病毒(Singapore grouper iridovirus, SGIV)和神经坏死病毒(Red-spotted grouper nervous necrosis virus, RGNNV)抗性的关联分析。【结果】在SGIV感染的易感组和抗感组样品中共筛查到9个SNP位点，均位于内含子中；多态信息含量(Polymorphism information content, PIC)的范围为0.177～0.375，其中，SNP-S1(g.940T>A)属于低度多态(PIC<0.25)，其余SNP位点属于中度多态(0.25≤PIC<0.50)；关联分析结果显示，SNP-S7(g.4595T>A)基因型频率在SGIV易感组和抗感组中存在显著差异分布(P<0.05),SNP-S7的...
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| 关 键 词： | 石斑鱼 虹彩病毒 神经坏死病毒 SNP PPAR-δ基因 |
| 收稿时间： | 2022/3/11 0:00:00 |
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