| 类乌齐牦牛ACTA1基因克隆、分子特性及差异表达分析 |
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| 引用本文： | 杨勤,柴志欣,王会,王吉坤,信金伟,姬秋梅,张成福,钟金城,罗晓林.类乌齐牦牛ACTA1基因克隆、分子特性及差异表达分析[J].西南农业学报,2019(6). |
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| 作者姓名： | 杨勤 柴志欣 王会 王吉坤 信金伟 姬秋梅 张成福 钟金城 罗晓林 |
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| 作者单位： | 西南民族大学青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部重点实验室;西藏自治区农牧科学院省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室;四川省草原科学研究院 |
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| 摘 要： | 【目的】骨骼肌α肌动蛋白1(actin alpha 1, ACTA1)主要参与骨骼肌纤维的发育,在骨骼肌活动中发挥重要作用。本试验主要扩增类乌齐牦牛ACTA1基因的cDNA序列,检测ACTA1基因在类乌齐牦牛不同组织中mRNA水平的表达规律。【方法】采用RT-PCR方法扩增并克隆类乌齐牦牛ACTA1基因CDS区;通过在线软件对其一级结构、二级结构、三级结构进行生物信息学分析;利用核苷酸序列及氨基酸序列进行同源性和系统进化树分析;应用RT-qPCR技术检测ACTA1基因在类乌齐牦牛不同组织中的表达模式。【结果】类乌齐牦牛ACTA1基因编码区全长1134 bp,结构稳定,共编码377个氨基酸。生物信息学分析发现,类乌齐牦牛ACTA1基因编码的蛋白质是一种结构较稳定、带负电的亲水性蛋白,二、三级结构以α-螺旋为主,包含2个明显的跨膜区域,无信号肽,属胞内蛋白。保守结构域中含有明显的NDB区域,蛋白结构高度保守。同源性分析表明,类乌齐牦牛与水牛ACTA1基因的核苷酸及氨基酸同源性均较高。系统进化树分析显示,类乌齐牦牛与水牛亲缘关系最近,黄牛次之。实时荧光定量PCR结果显示,ACTA1基因在臀肌和大脑高表达。【结论】获得类乌齐牦牛ACTA1基因的CDS区全长1134 bp,ACTA1基因在类乌齐牦牛肌肉和大脑组织中显著表达,为进一步研究分析ACTA1基因在调控牦牛肌肉发育及机制等方面奠定基础。
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