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| 栉孔扇贝消化盲囊细菌群落组成的季节变化分析 | |
| 引用本文： | 杨彩霞,李赟,张婧宇,王崇明.栉孔扇贝消化盲囊细菌群落组成的季节变化分析[J].水产学报,2012,36(10):1579-1584. |
| 作者姓名： | 杨彩霞 李赟 张婧宇 王崇明 |
| 作者单位： | 1. 中国水产科学研究院黄海水产研究所,山东青岛266071;中国海洋大学教育部海水养殖重点实验室,山东青岛266003 2. 中国海洋大学教育部海水养殖重点实验室,山东青岛,266003 3. 中国水产科学研究院黄海水产研究所,山东青岛,266071 |
| 基金项目： | 现代农业产业技术体系建设专项(CARS-48) |
| 摘 要： | 为分析栉孔扇贝消化盲囊内细菌群落组成及其季节变化,于2009年6月—2010年6月(2月份除外)定期从青岛沙子口流清河湾扇贝养殖海区采集养殖的2龄栉孔扇贝,采用SDS方法提取消化盲囊的总DNA,并通过引物358f和907r采用PCR扩增细菌16S rDNA的V3～V5区序列,利用变性梯度凝胶电泳(denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE)分离所得扩增序列。DGGE图谱显示,12个月份的样品共有不同位置的谱带11条,其中9条谱带作为共有谱带在所有月份的栉孔扇贝消化盲囊中均有分布,占总谱带数的81.82%,表明整个养殖季节栉孔扇贝消化盲囊内的细菌群落组成相对稳定。对11条DGGE条带进行切胶回收、PCR扩增、纯化、克隆后测序,其中9条谱带克隆测序成功。经BLAST比对搜索,结果显示9条序列与NCBI数据库中的序列相似性达97%～99%,所代表的细菌分别属于4大类群,变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、蓝细菌门(Cyanobacteria)和放线菌门(Actinobacteria);NCBI数据库中与其相近的细菌主要为马赛菌属(Massilia)、芽孢杆菌属(Bacillus)、微小杆菌属(Exiguobacterium)、聚球藻属(Synechococcus)、红球菌属(Rhodococcus)和未培养菌。 |
| 关 键 词： | 栉孔扇贝 消化盲囊 细菌群落 PCR-DGGE |
| 收稿时间： | 2012/3/16 0:00:00 |
| 修稿时间： | 7/20/2012 9:33:27 AM |
Seasonal changes of bacterial community composition in digestive diverticula of scallops Chlamys farreri |
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| YANG Cai-xi,LI Yun,ZHANG Jing-yu and WANG Chong-ming.Seasonal changes of bacterial community composition in digestive diverticula of scallops Chlamys farreri[J].Journal of Fisheries of China,2012,36(10):1579-1584. | |
| Authors: | YANG Cai-xi LI Yun ZHANG Jing-yu and WANG Chong-ming |
| Institution: | 1*(1.Yellow Sea Fisheries Research Institute,Chinese Academy of Fishery Sciences,Qingdao 266071,China; 2.Key Laboratory of Mariculture,Ministry of Education,Ocean University of China,Qingdao 266003,China) |
| Abstract: | |
| Keywords: | Chlamys farreri digestive diverticula bacteria community PCR-denaturing gradient gel electrophoresis(PCR-DGGE) |
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