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松辽黑猪IGF-I基因5'调控区序列特征分析
引用本文:刘畅,王大力,白文林,张金玉,张树敏,赵志辉.松辽黑猪IGF-I基因5''调控区序列特征分析[J].吉林农业大学学报,2009,31(2).
作者姓名:刘畅  王大力  白文林  张金玉  张树敏  赵志辉
作者单位:1. 吉林大学畜牧兽医学院,长春,130062
2. 黑龙江八一农垦大学动物科技学院,大庆,163319
3. 沈阳农业大学畜牧兽医学院,沈阳,110161
4. 吉林省农业科学院畜牧分院,公主岭,136100
基金项目:国家自然科学基金,国家高技术研究发展计划(863计划),吉林省科技发展计划项目 
摘    要:对松辽黑猪类胰岛素样生长因子-I(IGF-I)基因5'调控区进行了T-A克隆和序列测定,在分析序列结构特征的基础上与GenBank中野猪、大白猪、牛、山羊、绵羊进行了比较基因组学和系统进化研究.结果表明:松辽黑猪IGF-I基因5'调控区存在C/EBPb、MATM、Oct-1、CF-1等多个潜在的转录因子结合位点,可能与IGF-I的转录调控和起始以及特异表达有关.在该非编码序列中,重复序列所占比率为2.22%,不存在SINEs、LINEs、LTR类反转录元件和DNA转座子元件,而发现存在1个(CA)18微卫星位点.在松辽黑猪IGF-I基因5'调控区,松辽黑猪与野猪、大白猪、牛、山羊、绵羊各物种间同源性大小分别为99.0%、98.8%、90.7%、91.6%、90.6%.MUPD法构建的分子系统进化树聚类结果表明,野猪与大白猪先聚为一类,再与松辽黑猪聚类形成一个大分支,而山羊和绵羊先聚成一类,再与牛聚类形成一个大分支,然后再与猪的一支汇合在一起.

关 键 词:松辽黑猪  IGF-I基因  克隆  启动子

Sequence Characterization of the 5'-Regulatory Region of the IGF-IGene in Songliao Black Pig
LIU Chang,WANG Da-li,BAI Wen-lin,ZHANG Jin-yu,ZHANG Shu-min,ZHAO Zhi-hui.Sequence Characterization of the 5''-Regulatory Region of the IGF-IGene in Songliao Black Pig[J].Journal of Jilin Agricultural University,2009,31(2).
Authors:LIU Chang  WANG Da-li  BAI Wen-lin  ZHANG Jin-yu  ZHANG Shu-min  ZHAO Zhi-hui
Abstract:
Keywords:
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