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| 大白菜表达序列标签SSR标记分析* | |
| 引用本文： | 葛佳,谢华,崔崇士,洪剑明,马荣才.大白菜表达序列标签SSR标记分析*[J].农业生物技术学报,2005,13(4):423-428. |
| 作者姓名： | 葛佳 谢华 崔崇士 洪剑明 马荣才 |
| 作者单位： | 1. 北京农业生物技术研究中心,北京,100089;首都师范大学生命科学学院,北京,100037 2. 北京农业生物技术研究中心,北京,100089 3. 东北农业大学园艺学院,哈尔滨,150030 4. 首都师范大学生命科学学院,北京,100037 |
| 基金项目： | 国家高技术研究与发展（863）计划课题（No.2003AA207120）资助. |
| 摘 要： | 对大白菜（Brassica campestris L．ssppekinensis）13007个EST序列进行拼接共得到7714个片段重叠群（contig），其中10．4％（890个）非冗余EST含有SSR标记（EST-SSR），标记间平均间隔距离为3．9kb，单、双和三核苷酸重复序列大约各占1／3左右。CDS所包含的三核苷酸重复序列最多，而且AAG／CTT重复序列的含量最高。通过同源性比较分析，获得功能已知的SSR-ESTs774个，共计含有846个SSR，其中50．2％位于5＇-UTR，31．4％位于3＇-UTR，18．4％位于CDS。实验选取123个SSR座位设计引物，利用芜菁花叶病毒（Turnip mosaic virus，TuMV）的高抗和高感大白菜F6代自交系材料各2份，分析EST-SSR标记多态性。结果表明，其中37个标记可进行有效扩增，但是没有表现出多态性，23个标记（18．7％）至少在1份材料中具有多态性。对这些EST-SSR标记在大白菜和其它芸薹属植物的系统发育关系分析、遗传作图和基因定位的应用进行了讨论。 |
| 关 键 词： | EST EST-SSR 大白菜 SSR标记 标记分析 表达序列标签 EST序列 重复序列 芜菁花叶病毒 mosaic |
| 收稿时间： | 2004-09-21 |
| 修稿时间： | 2004-11-26 |
Analysis of Expressed Sequence Tags (ESTs) Derived SSR Markers in Chinese Cabbage (Brassica campestris L.ssp. pekinensis) |
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| GE Jia,XIE Hua,CHUI Chong-Shi,HONG Jian-Ming,MA Rong-Cai.Analysis of Expressed Sequence Tags (ESTs) Derived SSR Markers in Chinese Cabbage (Brassica campestris L.ssp. pekinensis)[J].Journal of Agricultural Biotechnology,2005,13(4):423-428. | |
| Authors: | GE Jia XIE Hua CHUI Chong-Shi HONG Jian-Ming MA Rong-Cai |
| Abstract: | |
| Keywords: | expressed sequence tag EST-SSR Brassica campestris L ssp pekinensis |
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