桤木Genomic-SSR与EST-SSR分子标记的差异分析 |
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引用本文: | 王泽亮,杨勇智,杜晋城,陈炙,黄振,郭洪英.桤木Genomic-SSR与EST-SSR分子标记的差异分析[J].四川林业科技,2023(4):36-42. |
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作者姓名: | 王泽亮 杨勇智 杜晋城 陈炙 黄振 郭洪英 |
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作者单位: | 1. 四川省林业科学研究院;2. 四川省草原科学研究院 |
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基金项目: | 世界银行贷款长江流域上游森林生态系统恢复项目(2019-510000-02-01-400761);;四川省科技计划项目(2021YFYZ0032); |
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摘 要: | 桤木(Alnus cremastogyne)为非豆科固氮树种,也是我国最重要的一个桤木属特有种,具有重要的生态功能。本文分析了桤木基因组SSR与EST-SSR两种来源标记的遗传差异,结果显示EST-SSR的平均等位基因数与平均有效等位基因数高于Genomic-SSR,而对平均观察杂合度与平均期望杂合度来说,Genomic-SSR高于EST-SSR,聚类分析显示Genomic-SSR与EST-SSR在小的分群上有差异,说明Genomic-SSR与ESTSSR标记在解析遗传多样性与遗传关系方面有一定差异,综合两种标记可以获得更加客观的结果。
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关 键 词: | 桤木 简单序列重复 遗传多样性 多倍体 GenoDive |
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