| 牛分枝杆菌CVCC68002全基因组测序与功能分析 |
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| 引用本文： | 王霞,马伟超,雒林通,裴芳,王廷璞.牛分枝杆菌CVCC68002全基因组测序与功能分析[J].甘肃农业大学学报,2023(5):11-24. |
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| 作者姓名： | 王霞 马伟超 雒林通 裴芳 王廷璞 |
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| 作者单位： | 1. 天水师范学院生物工程与技术学院;2. 天水市第五人民医院检验科 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目（31860707）；;甘肃省自然科学基金项目（20JR10RA796）； |
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| 摘 要： | 【目的】为进一步深入研究牛分枝杆菌CVCC68002基因组特征，致病性和遗传进化关系，为牛分支杆菌感染疾病的预防和深入研究提供参考。【方法】利用Illumina和Pacbio测序技术平台对CVCC68002菌株进行全基因组测序建库，采用生物信息学和系统进化树等方法，对该菌株基因组功能注释、致病性和遗传进化关系进行了分析。【结果】通过分析发现该菌株基因组全长4 357 100 bp,GC含量为65.64%，编码基因达4 145个；在GO、KEGG、COG、NR数据库基因组特征显示其具有高氨基酸和碳水化合物代谢能力。通过PHI,VFDB,ARDC和CARD数据库对其致病性进行相关分析，得到456个毒力基因注释，主要涉及细菌黏附与定殖、细菌逃避宿主免疫防御系统、分泌系统蛋白和转录因子等。并找到相关包括万古霉素，青霉素，多胺类抗生素、异烟肼、吡嗪酰胺、氟喹诺酮等的抗药性基因，另外，外排泵的抗性蛋白注释量显著，推测牛分枝杆菌通过外排抗性蛋白从而达到抗药自我保护的目的。【结论】获得牛分枝杆菌CVCC68002株完整基因组信息，完善系统进化信息，明确了其毒力因子和有效地靶标抗药基因，为后续对该菌株分...
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| 关 键 词： | 牛分枝杆菌 基因组测序 致病性分析 毒力因子 耐药性分析 |
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