绵羊肺炎支原体延伸因子Tu基因的分子特性分析 |
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引用本文: | 尹正军,岳华,汤承.绵羊肺炎支原体延伸因子Tu基因的分子特性分析[J].畜牧兽医学报,2015(2):288-294. |
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作者姓名: | 尹正军 岳华 汤承 |
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作者单位: | 西南民族大学生命科学与技术学院 |
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基金项目: | “十二五”高技术研究发展计划(863计划)(2012AA101304) |
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摘 要: | 对绵羊肺炎支原体(Mycoplasma ovipneumoniae)参考菌株Y98株和11个临床分离株的tuf基因进行克隆、测序,生物信息学分析及构建进化树,分析绵羊肺炎支原体tuf基因的分子结构特性。结果表明:Y98株和11株分离株tuf基因编码区全长1 209bp,编码402个氨基酸,氨基酸相似性为93.3%~100%,有较高的抗原指数和抗原表位,不含信号肽,平均GC含量为39.80%。Y98株与10个分离株延伸因子Tu存在1个跨膜区,含有6种不同的功能位点。而一分离株该蛋白质存在2个跨膜区,在271—274位点多出1个N-糖基化位点。12个菌株的tuf基因有117个单核苷酸突变位点,其中无义突变为41个,有义突变为76个,造成53个推导的氨基酸变化,主要发生在325—354位点靠近羧基端,有可能导致该蛋白质功能的改变。基于该基因的遗传进化与全基因组建立的进化关系一致,比16SrRNA基因更适合作为绵羊肺炎支原体进化关系的分子靶标。该基因种内保守同时也存在遗传多样性,作为分子分型的潜力值得进一步研究。
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关 键 词: | 绵羊肺炎支原体 tuf基因 克隆 分子特性 遗传进化 |
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