| 喜树碱关键酶基因的克隆与生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 王瑶瑶,丁剑兰,韩卓,郭亚鑫,刘诗卉,刘晓宁.喜树碱关键酶基因的克隆与生物信息学分析[J].现代农业科技,2019(2). |
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| 作者姓名： | 王瑶瑶 丁剑兰 韩卓 郭亚鑫 刘诗卉 刘晓宁 |
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| 作者单位： | 黄河科技学院医学院 |
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| 摘 要： | 为了克隆喜树碱生物合成途径关键酶异胡豆苷合成酶的基因STR,本文对喜树幼叶进行RNA提取,利用RT-PCR克隆基因STR的CDS序列,利用在线软件ExPASy ProtParam、SignalP4.1、TMHMMV.2.0、TargetP 1.1分析蛋白理化性质、蛋白信号肽、蛋白跨膜区以及亚细胞定位,利用在线工具Conserved Domain、SOPMA预测蛋白保守结构域和二级结构,利用MEGA 6.0软件构建蛋白系统进化树。结果表明,以喜树幼芽为材料,通过RT-PCR克隆喜树碱生物合成途径关键酶基因STR的CDS序列为993 bp;生物信息学分析表明,STR定位于分泌通道,为酸性蛋白,无信号肽,有1个跨膜区,由α-螺旋、延伸链、β-转角和无规则卷曲等二级结构组成;STR包含高度保守的结构域,聚类分析表明其与中果咖啡具有较高的相似性、较近的亲缘关系和遗传距离。
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| 关 键 词： | 喜树碱 异胡豆苷合成酶 RT-PCR 基因克隆 生物信息学分析 |
Cloning and Bioinformatic Analysis of Key Enzyme in Camptotheca acuminata |
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