| 野禽源AIV PB1-F2基因的遗传进化及部分氨基酸位点组成分析 |
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| 引用本文： | 张进,李雁冰,柴洪亮,张兰兰,华育平.野禽源AIV PB1-F2基因的遗传进化及部分氨基酸位点组成分析[J].中国兽医学报,2011,31(5). |
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| 作者姓名： | 张进 李雁冰 柴洪亮 张兰兰 华育平 |
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| 作者单位： | 1. 东北林业大学生命科学学院,黑龙江哈尔滨,150040
2. 中国农业科学院哈尔滨兽医研究所农业部动物流感重点开放实验室/兽医生物技术国家重点实验室,黑龙江哈尔滨,150001 |
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| 基金项目： | 兽医生物技术国家重点实验室开放课题基金资助项目 |
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| 摘 要： | 在完成14株野禽源AIV PB1-F2基因克隆、测序的基础上,对其进行了同源性、遗传进化关系及氨基酸编码特征的比较分析.结果发现,H5N1亚型高致病性毒株A/lesser_kestrel/Harbin/194/2007(H5N1)PB1-F2的第37,48,50位氨基酸分别为精氨酸、脯氨酸、甘氨酸,与其他13个低致病性毒株均不相同(其分别为谷氨酰胺、谷氨酰胺、天冬氨酸).为探讨这一现象,从NCBI Influenza Virus Resource中选取1061个AIV毒株的PB1-F2基因序列进一步展开分析,结果表明:在第37,48,50位氨基酸位点上,97香港H5N1、其他H5N1及其他亚型AIV在此3个位点上氨基酸的构成存在着较为明显的差异,而且还呈现出了一定的规律和特点;并且研究还发现在此3个位点上,H9N2亚型毒株也表现出了较强的时间和空间分布特征.针对PB1-F2基因的遗传进化关系分析表明,H5N1及香港系毒株较其他AIV存在较远的遗传距离.随机的突变和重组似乎不足以解释这种差异及遗传距离形成的原因,其生物学意义有待于进一步探讨.
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| 关 键 词： | 野禽源禽流感病毒 PB1-F2基因 遗传进化 氨基酸组成 |
Analysis of gene phylogenesis and amino acid composition of PB1-F2 of AIVs isolated from wild birds |
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| ZHANG Jin,LI Yan-bing,CHAI Hong-liang,ZHANG Lan-lan,HUA Yu-ping.Analysis of gene phylogenesis and amino acid composition of PB1-F2 of AIVs isolated from wild birds[J].Chinese Journal of Veterinary Science,2011,31(5). |
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| Authors: | ZHANG Jin LI Yan-bing CHAI Hong-liang ZHANG Lan-lan HUA Yu-ping |
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