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H9N2亚型禽流感病毒西藏分离株的全基因组遗传进化分析
引用本文:索朗斯珠,邹威,王灿,柯尖江,朱记平,陈焕春,金梅林.H9N2亚型禽流感病毒西藏分离株的全基因组遗传进化分析[J].中国兽医学报,2011,31(5).
作者姓名:索朗斯珠  邹威  王灿  柯尖江  朱记平  陈焕春  金梅林
作者单位:1. 华中农业大学农业微生物国家重点实验室,湖北武汉430070;西藏农牧学院动物科学学院,西藏林芝860000
2. 华中农业大学农业微生物国家重点实验室,湖北武汉,430070
基金项目:国家"973"计划资助项目,"艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治"科技重大专项资助项目,华中农业大学农业微生物国家重点实验室开放基金资助项目,西藏农牧学院211工程师资队伍建设资助项目
摘    要:根据GenBank登陆的H9N2亚型AIV全基因组序列,设计了8对引物,运用RT-PCR的方法获取了3株H9N2亚型AIV西藏分离株A/Chiken/Tibet/S1/2009、A/Duck/Tibet/S2/2009和A/Chiken/Tibet/S4/2009的8个基因序列,并对所得序列进行同源性及遗传进化分析.结果显示,分离毒株的各基因片段均有完整的开放阅读框,HA基因裂解位点处均为RSSR/G,符合低致病性禽流感的特征;3株西藏分离毒株之间同源性为98%~99%,可能起源于同一种系;各分离毒的HA、NS和NA基因与欧亚分支A/Chiken/Beijing/1/94分支中的A/Duck/HongKong/Y280/97遗传距离最近,而M、NP、PA、PB1和PB2基因与欧亚分支中另一分支A/Quail/HongKong/G1/97群系遗传关系近.由此可见3株分离株的各基因所属分支不具有统一性,说明本研究所分离的3株H9N2亚型AIV西藏分离毒株可能是来源于不同亚系AIV的毒株在感染同一种宿主时发生基因重排的产物.

关 键 词:H9N2亚型禽流感病毒  RT-PCR  遗进化分析

Whole genome sequencing and analysis of avian influenza virus subtype H9N2 isolated in Tibet province
Suolangsizhu,ZOU Wei,WANG Can,KE Jian-jiang,ZHU Ji-ping,CHEN Huan-chun,JIN Meilin.Whole genome sequencing and analysis of avian influenza virus subtype H9N2 isolated in Tibet province[J].Chinese Journal of Veterinary Science,2011,31(5).
Authors:Suolangsizhu  ZOU Wei  WANG Can  KE Jian-jiang  ZHU Ji-ping  CHEN Huan-chun  JIN Meilin
Abstract:
Keywords:
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