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2种猪圆环病毒2型TaqMan实时荧光定量PCR检测方法的建立及比较
引用本文:周忠涛,王小敏,汪伟,茅爱华,温立斌,倪艳秀,何孔旺.2种猪圆环病毒2型TaqMan实时荧光定量PCR检测方法的建立及比较[J].农业科学与技术,2015(1).
作者姓名:周忠涛  王小敏  汪伟  茅爱华  温立斌  倪艳秀  何孔旺
作者单位:1. 江苏省农业科学院兽医研究所,农业部兽用生物制品工程技术重点实验室,国家兽用生物制品工程技术研究中心,江苏南京 210014; 南京农业大学动物医学院,江苏南京210095
2. 江苏省农业科学院兽医研究所,农业部兽用生物制品工程技术重点实验室,国家兽用生物制品工程技术研究中心,江苏南京 210014
基金项目:国家自然科学基金(31302071);公益性行业(农业)科研专项(201303046);江苏省自主创新项目(CX(14)2045);江苏省第四期"333高层次人才培养工程"(第二层次)资助项目(BRA2012194)。@@@@Supported by National Natural Science Foundation of China,Special Fund for Agro-scientific Research in the Public lnterest,Jiangsu Agricultural Science and Technology lnnovation Fund (CX,"333 High-level Personnel Training Project"of Jiangsu Province
摘    要:目的]实现在体外对猪圆环病毒2型(Porcine circovirus type 2,PCV2)的定量检测。方法]设计合成2组特异性引物和 TaqMan探针,构建分别包含 PCV2 ORF1和 ORF2基因全长的重组质粒作为标准品,经过反应体系和反应条件的优化,绘制标准曲线,建立2种检测PCV2的分别基于 PCV2 ORF1和 ORF2的TaqMan荧光定量PCR方法。结果]所建立的2条标准曲线的 Ct值与模板拷贝数的对数之间具有良好的线性关系,相关系数 R均在0.99以上,扩增效率均在90%~110%;重复性好,组内变异系数均小于5%;特异性强,以猪细小病毒(PPV)、猪圆环病毒1型(PCV1)、猪伪狂犬病毒(PRV)、猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)为模板时均无扩增;敏感性高,ORF1方法可达1.0×101 copies/μl,ORF2方法可达1.0×102 copies/μl。用建立的2种荧光定量PCR方法分别对80份临床样品进行检测并对结果进行比较,结果表明,其中72份临床样品的定量结果数量级基本一致,有8份临床样品的定量结果数量级不一致。利用 SYBR GreenⅠ荧光定量PCR方法对8份样品进行了检测,证明这8份样品中确实存在 P1的感染。结论]基于ORF1建立的定量检测方法更为准确,可用于PCV2的快速诊断和定量检测。

关 键 词:猪圆环病毒2型  TaqMan荧光定量  ORF1  ORF2  类猪圆环病毒因子  P1

Establishment and Comparison of Two TaqMan Real-time PCR Methods for PCV2
Abstract:
Keywords:PCV2  TaqMan real-time PCR  ORF1  ORF2  PCV2-like factor P1
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