兔瘟病毒西宁分离株的分子鉴定及进化分析 |
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引用本文: | 简莹娜,张学勇,徐龙,李秀萍,王戈平,刘振伟,蔡其刚,王光华,陈永忠,马利青.兔瘟病毒西宁分离株的分子鉴定及进化分析[J].青海畜牧兽医杂志,2018(3). |
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作者姓名: | 简莹娜 张学勇 徐龙 李秀萍 王戈平 刘振伟 蔡其刚 王光华 陈永忠 马利青 |
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作者单位: | 青海省畜牧兽医科学院;青海大学畜牧兽医科学院省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室;西宁市畜牧兽医工作站 |
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摘 要: | 本研究首次对处于青藏高原的西宁的兔瘟病毒分离株(命名为RHDV-QHXN1)进行了VP60基因克隆、测序,并与参考株、我国各地区流行株和其他国家流行株进行了基因非同义置换氨基酸分析,以及基因同源性的比较和进化树分析。兔子解剖病理学显示为典型的兔瘟临床症状;并进行了PCR分子鉴定,获得了预期大小的基因片段,测序分析比对分析后确定为兔瘟病毒,命名为RHDV-QHXN1分离株。该分离株与其他参考毒株AY269825(中国江苏南京)和DQ530363(中国陕西杨凌)的核苷酸同源性分别为97.41%和97.13%,氨基酸同源性达99.14和99.31%。进化树分析显示,RHDV-QHXN1与AY269825(中国江苏南京)株聚成微小分支。对RHDV-QHXN1分离株VP60基因的非同义置换的氨基酸分析结果显示,突变位点共有6处,分别位于第351位、359位、370位、432位、508位和573位的氨基酸处。
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