| 西农萨能奶山羊SERPINA1基因克隆、生物信息学及组织表达分析 |
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| 引用本文： | 潘檀,高梁嘉慧,程菲,罗军,李聪.西农萨能奶山羊SERPINA1基因克隆、生物信息学及组织表达分析[J].中国畜牧兽医,2020,47(7):1971-1980. |
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| 作者姓名： | 潘檀 高梁嘉慧 程菲 罗军 李聪 |
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| 作者单位： | 西北农林科技大学动物科技学院, 陕西省动物遗传育种与繁殖重点实验室, 杨凌 712100 |
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| 基金项目： | 陕西省重点研发计划重点产业创新链（2018ZDCXL-NY-01-05）；国家自然科学基金（31702098）；陕西省博士后科学基金（2017BSHEDZZ107） |
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| 摘 要： | 本研究旨在克隆西农萨能奶山羊SERPINA1基因的CDS区，采用生物软件和在线预测工具进行生物信息学分析，通过实时荧光定量PCR技术检测SERPINA1基因在西农萨能奶山羊各组织间mRNA的表达水平。根据GenBank中山羊SERPINA1基因CDS区序列（登录号：XM_018066209.1），利用Primer Premier 5.0软件设计特异性引物，RT-PCR扩增目的基因，构建原核表达载体测序后对序列进行生物信息学分析；采集西农萨能奶山羊心脏、肝脏、脾脏、肺脏、乳腺、肾脏、肌肉、瘤胃和小肠组织，提取组织RNA，反转录为cDNA模板，设计特异性定量引物，进行实时荧光定量PCR，检测SERPINA1基因在不同组织中的表达差异。结果显示，西农萨能奶山羊SERPINA1基因CDS区全长1 326 bp，编码441个氨基酸；同源性比对分析显示，西农萨能奶山羊与山羊、绵羊、牛和小鼠SERPINA1基因核苷酸序列同源性分别为100%、98.6%、95.7%和71.6%，与山羊亲缘关系最近，其次是绵羊。SERPINA1蛋白分子质量为48.71 ku，等电点为5.71，为跨膜亲水蛋白；SERPINA1氨基酸序列分别有62个磷酸化位点，3个跨膜区结构。组织表达分析显示，SERPINA1基因在西农萨能奶山羊肝脏组织中显著高表达（P<0.05），其次是乳腺组织，在肺脏组织中表达量最低。研究结果为进一步探究SERPINA1基因在奶山羊乳蛋白合成代谢中的作用提供理论依据。
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| 关 键 词： | 西农萨能奶山羊 SERPINA1基因 克隆 生物信息学分析 组织表达 |
| 收稿时间： | 2019-11-27 |
Cloning,Bioinformatics and Tissue Expression Analysis of SERPINA1 Gene in Xinong Saanen Dairy Goats (Capra hircus) |
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| PAN Tan,GAO Liangjiahui,CHENG Fei,LUO Jun,LI Cong.Cloning,Bioinformatics and Tissue Expression Analysis of SERPINA1 Gene in Xinong Saanen Dairy Goats (Capra hircus)[J].China Animal Husbandry & Veterinary Medicine,2020,47(7):1971-1980. |
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| Authors: | PAN Tan GAO Liangjiahui CHENG Fei LUO Jun LI Cong |
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| Institution: | Key Laboratory of Animal Genetics, Breeding and Reproduction of Shaanxi Province, College of Animal Science and Technology, Northwest A&F University, Yangling 712100, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Xinong Sannen dairy goats SERPINA1 gene cloning bioinformatics analysis tissue expression |
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