| 暗纹东方鲀不同养殖模式下的微生物群落结构 |
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| 引用本文： | 邱楚雯,施永海,王韩信.暗纹东方鲀不同养殖模式下的微生物群落结构[J].水产学报,2021,45(2):209-220. |
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| 作者姓名： | 邱楚雯 施永海 王韩信 |
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| 作者单位： | 上海市水产研究所，上海市水产技术推广站,上海市水产研究所，上海市水产技术推广站,上海市水产研究所，上海市水产技术推广站 |
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| 基金项目： | 上海市科技兴农重点攻关项目(G20180208)；上海长江口主要经济水生动物人工繁育工程技术研究中心(13DZ2251800)；上海市农业领军人才项目(G201860) |
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| 摘 要： | 为探究暗纹东方鲀不同养殖模式下的细菌群落结构特征，本实验采用Illumina Miseq 高通量测序方法对传统养殖与立体种养2种模式下水体、底泥及暗纹东方鲀肠道细菌的16S rRNA基因的2个高变区(V3-V4)进行测序分析，利用冗余分析(redundancy analysis, RDA)水体菌群与环境因子的关系，典型关联分析(canonical correlation analysis, CCA)肠道菌群与环境因子的关系。结果显示：立体种养模式下水体、底泥及暗纹东方鲀肠道细菌群落的丰富度及多样性大于传统养殖模式。立体种养模式下水体及底泥的细菌群落结构与传统养殖模式的较为类似，其中水体的优势菌门为放线菌门、蓝细菌门、变形菌门和拟杆菌门；底泥的优势菌门为变形菌门和拟杆菌门。传统养殖模式下肠道的主要优势菌属为红球菌属Rhodococcus，立体种养模式下肠道主要优势菌属为葡萄球菌属Staphylococcus、弓形杆菌属Arcobacter、norank_f_norank_o_Chloroplast、Elizabethkingia和支原体属Mycoplasma。环境因子关联分析结果显示：pH对水体细菌群落具有显著影响。不同养殖模式下水体的优势菌属红球菌属与总悬浮固体(TSS)、总磷(TP)、总氮(TN)、pH和硝酸盐呈正相关。总氨氮(TAN)对暗纹东方鲀肠道细菌群落影响最大，暗纹东方鲀肠道的优势菌属红球菌属、弓形杆菌属与TSS、TP呈正相关；不动杆菌属Acinetobacter、支原体属与TAN、亚硝酸盐、硝酸盐呈正相关；魏斯氏菌属Weissella、葡萄球菌属与TSS、COD、TP、TN、硝酸盐、亚硝酸盐和TAN呈负相关。研究表明，采用立体种养模式可提高养殖系统的细菌多样性，降低病害爆发风险，有助于抑制蓝细菌生长，减小养殖对象的氧化应激损伤。此外，养殖模式能够通过改变水体中氮、磷的含量对水体和暗纹东方鲀肠道的微生物群结构产生一定的影响。
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| 关 键 词： | 暗纹东方鲀 传统养殖 立体种养 水体 底泥 肠道 菌群结构 高通量测序 |
| 收稿时间： | 2020/2/27 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2020/6/10 0:00:00 |
Microbial community structure in different cultural patterns of Takifugu obscures |
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| QIU Chuwen,SHI Yonghai,WANG Hanxin.Microbial community structure in different cultural patterns of Takifugu obscures[J].Journal of Fisheries of China,2021,45(2):209-220. |
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| Authors: | QIU Chuwen SHI Yonghai WANG Hanxin |
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| Institution: | Shanghai Fisheries Research Institute,Shanghai Fisheries Technical Extension Station,Shanghai Fisheries Research Institute,Shanghai Fisheries Technical Extension Station,Shanghai Fisheries Research Institute,Shanghai Fisheries Technical Extension Station |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Takifugu obscurus traditional aquaculture three-dimensional cultivation water sediment intestine microbial community structure high-throughput sequencing |
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