| 苹果miR396家族鉴定及在不定根发育过程中的表达分析 |
| |
| 引用本文： | 韦燕红,刘 桢,李 珂,孟 媛,汪 蕙,毛江萍,马豆豆,李少欢,马娟娟,卢 显,张 东.苹果miR396家族鉴定及在不定根发育过程中的表达分析[J].园艺学报,2020,36(7):1237-1252. |
| |
| 作者姓名： | 韦燕红 刘 桢 李 珂 孟 媛 汪 蕙 毛江萍 马豆豆 李少欢 马娟娟 卢 显 张 东 |
| |
| 作者单位： | 西北农林科技大学园艺学院，国家苹果改良中心杨凌分中心，陕西杨凌 712100 |
| |
| 基金项目： | 国家重点研发计划重点项目（2019YFD1001803）；陕西省重点研发计划项目（2017ZDXM-NY-019，2019TSLNY02-04）；国家现代农业产业技术体系建设专项资金项目（CARS-27）；“仲英青年学者”项目 |
| |
| 摘 要： | 分析了苹果miR396家族进化特性及其在苹果不定根发育过程中的表达模式。结果表明：苹果miR396家族有4条成熟体和7条前体序列（pre-miRNA）。Mfold预测显示Pre-miR396家族7个成员序列均可形成典型稳定的茎环二级结构，最小折叠自由能介于–62.9 kal ? mol-1（pre-miR396b）~–51.9 kal ? mol-1（pre-miR396g）之间。系统发育进化树分析显示，pre-miR396家族亲缘关系可分为3个亚组（G1、G2、G3），每个亚组内基因数量不同，分别含有11、9、19个。靶基因预测显示，苹果miR396靶基因包括MdGRF1、MdGRF2和MdGRF5等，降解组测序进一步验证了miR396对其候选靶基因MdGRF1、MdGRF2和MdGRF5的剪切关系。苹果miR396家族成员在侧根和果实中的表达量显著高于其他组织，其候选靶基因表达量则在花芽和腋芽中显著高于其他组织；不定根发育过程中，miR396家族不同成员表达模式存在显著差异，整体上呈上调表达趋势，其候选靶基因呈下调表达趋势；外源IBA处理显著诱导miR396家族成员的表达，尤其是在不定根诱导期和根系生长期更为显著。
|
| 关 键 词： | 苹果 miR396 不定根发育 生物信息学分析 基因表达 |
Role of endoplasmic reticulum stress in cardiomyocyte apoptosis induced by trauma in rats |
| |
| YU Xue-jiao,HE Jin-ling,YANG Bo-wen,JIAO Xiang-ying,CAO Ji-min,HE Zhong-mei,YAN Zi.Role of endoplasmic reticulum stress in cardiomyocyte apoptosis induced by trauma in rats[J].Acta Horticulturae Sinica,2020,36(7):1237-1252. |
| |
| Authors: | YU Xue-jiao HE Jin-ling YANG Bo-wen JIAO Xiang-ying CAO Ji-min HE Zhong-mei YAN Zi |
| |
| Institution: | College of Horticulture，Northwest A & F University，National Apple Improvement Center Yangling Sub-center，Yangling，Shaanxi 712100，China |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | Trauma Heart Apoptosis Endoplasmic reticulum stress Rats |
|
| 点击此处可从《园艺学报》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《园艺学报》下载免费的PDF全文 |
