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利用马克隆值差异显著的BILs鉴定棉纤维品质相关基因
引用本文:吴嫚,李龙云,裴文锋,Zhang Jinfa,于霁雯.利用马克隆值差异显著的BILs鉴定棉纤维品质相关基因[J].棉花学报,2020,32(1):52-62.
作者姓名:吴嫚  李龙云  裴文锋  Zhang Jinfa  于霁雯
作者单位:中国农业科学院棉花研究所/棉花生物学国家重点实验室郑州大学研究基地;Department of Plant and Environmental Science
基金项目:国家重点研发计划(2018YFD0100300)。
摘    要:【目的】马克隆值是衡量棉纤维品质的重要指标之一。利用马克隆值存在显著差异的2个陆海回交近交系材料进行高通量基因芯片分析,旨在筛选和鉴定棉纤维发育相关的关键基因。【方法】从SG747(Gossypium hirsutum L.)和Giza75(Gossypium Barbadense L.)高世代回交近交系(Backcross Inbred Lines,BILs)群体中选取NMGA-140(马克隆值6.2)和NMGA-051(马克隆值4.0)为材料,利用Affymetrix公司的棉花寡聚核苷酸基因芯片对其开花后10 DPA(Days after anthesis)的棉纤维进行了表达谱分析。【结果】获得了2655个差异表达基因,包括功能预测基因(15.57%),翻译、核糖体结构与生物合成相关基因(13.54%)和翻译后修饰、蛋白质转换、分子伴侣相关基因(9.31%)等。推测β-tub10正向调控棉纤维发育过程,β-tub1负向调控棉纤维发育过程,Ghi.3578.1.S1_s_at在棉纤维发育早期起到了作用。【结论】为棉花纤维品质的遗传改良提供了丰富的基因资源,为分子标记辅助育种开发更多新的分子标记。

关 键 词:棉纤维品质  马克隆值  基因芯片  差异表达基因

Identification of Differentially Expressed Genes in Developing Cotton Fibers between Two Groups of Backcross Inbred Lines Differing in Fiber Micronaire
Wu Man,Li Longyun,Pei Wenfeng,Zhang Jinfa,Yu Jiwen.Identification of Differentially Expressed Genes in Developing Cotton Fibers between Two Groups of Backcross Inbred Lines Differing in Fiber Micronaire[J].Cotton Science,2020,32(1):52-62.
Authors:Wu Man  Li Longyun  Pei Wenfeng  Zhang Jinfa  Yu Jiwen
Institution:1.Zhengzhou Research Base, State Key Laboratory of Cotton Biology, Zhengzhou University, Institute of Cotton Research, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Anyang 455000, Henan, China. 2.Department of Plant and Environment Sciences, New Mexico State University, Las Cruces 880033, USA
Abstract:
Keywords:fiber quality  fiber micronaire  affymetrix microarray  aifferential expressed genes  
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