枳Rboh基因家族全基因组鉴定及表达分析 |
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引用本文: | 梁梦鸽,马铭远,刘腾,徐小勇.枳Rboh基因家族全基因组鉴定及表达分析[J].扬州大学学报(农业与生命科学版),2023(4):107-112+136. |
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作者姓名: | 梁梦鸽 马铭远 刘腾 徐小勇 |
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作者单位: | 扬州大学园艺园林学院 |
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基金项目: | 国家重点研发计划项目(2018YFD1000107);;江苏省农业科技自主创新资金项目[CX(21)3024]; |
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摘 要: | 植物呼吸爆发氧化酶(Rboh)可调控活性氧的产生,在植物生长发育和胁迫响应中起着重要作用。基于已公布的枳全基因组数据,利用生物信息学方法对枳Rboh基因家族成员进行鉴定,并分析其理化特征、基因结构、保守域信息、系统进化关系、启动子顺式作用元件和组织表达模式。结果表明:枳基因组中共有7个Rboh家族成员,分布在4条染色体和未知染色体上,被预测定位到细胞膜上;共有12~15个外显子,4~5个保守结构域,8~10个motif;系统进化分析分成5个亚组,与拟南芥Rboh基因之间存在更多的共线性关系;枳Rboh基因启动子区域共有38种顺式作用元件,包括生长发育元件、激素响应元件和逆境响应元件3大类型;枳Rboh基因表达具有组织特异性。这一研究为进一步研究枳Rboh基因功能提供了重要参考信息。
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关 键 词: | 枳 Rboh基因 进化树 顺式作用元件 基因表达 |
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