番茄含糖量不同的两个材料果实转录组初步分析 |
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引用本文: | 张文昊,张辉,刘雨婷,王艳,张迎迎,王馨曼,王全华,朱为民,杨学东.番茄含糖量不同的两个材料果实转录组初步分析[J].园艺学报,2024(2):281-294. |
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作者姓名: | 张文昊 张辉 刘雨婷 王艳 张迎迎 王馨曼 王全华 朱为民 杨学东 |
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作者单位: | 1. 上海市农业科学院园艺研究所,上海市设施园艺重点实验室;2. 上海师范大学生命科学学院;3. 安徽省农业科学院园艺研究所 |
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摘 要: | 以高含糖量(8%)和普通含糖量(4.5%)番茄为研究材料,选取绿熟期、转色期、粉红期和红熟期的果实样品,通过转录组测序比较两种材料间的基因表达差异。分析表明,普通番茄与高糖番茄4个时期共有的差异基因有288个,其中下调的有174个,上调的有114个,转色期特有的差异表达基因数量最多。GO分析表明,差异表达基因显著富集在转色期,且富集的GO功能类也最多。KEGG分析表明,转色期富集的差异表达基因及相关通路最多,主要集中在糖、酸代谢等通路。对糖、酸代谢过程关键酶的相关基因进行聚类分析,发现有30个关键差异表达基因。
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关 键 词: | 番茄 含糖量 成熟期 转录组分析 |
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