| 基于SNP标记的小麦品种遗传相似度及其检测准确度分析 |
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| 引用本文： | 许乃银,金石桥,晋芳,刘丽华,徐剑文,刘丰泽,任雪贞,孙全,许栩,庞斌双.基于SNP标记的小麦品种遗传相似度及其检测准确度分析[J].作物学报,2024(4):887-896. |
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| 作者姓名： | 许乃银 金石桥 晋芳 刘丽华 徐剑文 刘丰泽 任雪贞 孙全 许栩 庞斌双 |
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| 作者单位： | 1. 江苏省农业科学院经济作物研究所;2. 全国农业技术推广服务中心;3. 北京市农林科学院杂交小麦研究所 |
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| 摘 要： | 遗传相似度检测的准确度估计是对SNP标记法在农作物品种检测体系中应用的必要补充和完善。本研究基于2021年小麦品种SNP标记法跨实验室协同验证实验数据,分析了该方法的检测准确度及在品种间的遗传相似度。分析结果表明:(1) 10个实验室对55组小麦品种组合的标记位点相似度检测的总体准确度约为98%。(2) GGE双标图的品种遗传关系功能图显示,7组小麦品种的组内遗传相似度在95%以上,其余组合的遗传相似度较低。(3)依据GGE双标图的“正确度-精确度”功能图和“准确度排序”功能图,发现洛旱7号/洛旱11等品种组合的相似度检测准确度较高,晋麦47/临抗11的检测准确度一般,而济麦22/婴泊700的检测准确度较差。(4)10个实验室的检测准确度存在显著差异,其中2个实验室检测的正确度、精确度和准确度表现显著差于其余实验室。(5)各实验室检测正确度的容许误差分布于1.3%～1.9%之间,平均为1.5%;准确度的容许误差分布于1.5%～2.0%之间,平均为1.7%。其中,Lab2和Lab3的检测正确度和准确度的容许误差显著差于其余实验室。本研究构建了SNP标记法对品种相似性检测的准确度统计模型,...
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| 关 键 词： | 小麦(Triticum aestivum L.) GGE双标图 SNP标记 遗传相似度 位点相似度 准确度 |
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