| 树鼩肠道菌群多样性与功能预测研究 |
| |
| 引用本文： | 杨学芳,李波,郑红,曹雪,王利梅.树鼩肠道菌群多样性与功能预测研究[J].安徽农业科学,2019,47(8). |
| |
| 作者姓名： | 杨学芳 李波 郑红 曹雪 王利梅 |
| |
| 作者单位： | 昆明医科大学科研实验中心,云南昆明,650500;昆明医科大学研究生院,云南昆明,650500;昆明医科大学实验动物学部,云南昆明,650500 |
| |
| 摘 要： | 目的]鉴定树鼩的肠道菌群,分析树鼩肠道菌群多样性和丰度,并进行菌群功能预测。方法]随机采集3份雄性树鼩粪便样品,提取树鼩粪便中细菌基因组DNA,通过PCR扩增获得16S rRNA V3～V4片段,采用高通量Illumina PE300平台进行测序,利用BIPES以及QIIME分析并比较菌群结构及多样性。最后,通过PICRUS t软件对肠道菌群的功能进行预测。结果]树鼩肠道粪便细菌有9门20纲33目53属122种208个OTU。门水平上,优势菌群为厚壁菌门(Firmicutes)和变形菌门(Proteobacteria);属水平上,埃希氏杆菌属(Escherichia)、乳酸菌属(Lactobacillus)和肠球菌属(Enterocossus)为优势菌群。PICRUS t功能预测结果表明,肠道细菌编码的大多数基因与代谢相关,其次是基因信息加工、环境信息加工。COG功能分类分析表明肠道微生物基因在"氨基酸的运输和代谢"和"碳水化合物运输与代谢"功能类群的相对丰度较高。结论]PICRUS t功能预测到树鼩肠道菌群主要与代谢相关,树鼩肠道菌群是研究肠道菌群与代谢类疾病的一种良好试验材料。
|
| 关 键 词： | 树鼩 肠道菌群 16SrRNA 菌株功能 |
Study on the Diversity and Function Prediction of Intestinal Flora in Tupaia belangeri |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | |
| 本文献已被 万方数据 等数据库收录！ |
|
