| 五加科植物鲨烯合酶核苷酸及其编码氨基酸序列的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 魏磊,常霞,全彦涛,陈飞,景炳年,崔炜,朱杰,王伟.五加科植物鲨烯合酶核苷酸及其编码氨基酸序列的生物信息学分析[J].江苏农业科学,2019(12). |
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| 作者姓名： | 魏磊 常霞 全彦涛 陈飞 景炳年 崔炜 朱杰 王伟 |
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| 作者单位： | 河南省生物技术开发中心/河南省植物天然产物开发工程技术研究中心 |
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| 摘 要： | 鲨烯合酶(squalene synthase,EC2.5.1.21,简称SQS)是三萜类化合物生物合成通路的关键酶之一。采用生物信息学方法对13种五加科植物的SQS核苷酸及其编码氨基酸序列的结构、理化性质、磷酸化位点、亲/疏水性、信号肽、导肽、跨膜结构域、亚细胞定位、二级结构、功能域、三级结构及进化关系进行初步预测和分析,并构建SQS蛋白家族的系统进化树。结果表明,13种五加科植物的SQS氨基酸序列结构与理化性质基本一致,均表现出亲水性,没有信号肽,具有跨膜结构域;亚细胞定位分析显示,除Panax sokpayensis定位于内质网膜上,其余均定位于质膜上。α螺旋和无规则卷曲为SQS二级结构中最主要的结构元件,保守区包括底物结合区、镁离子结合位点、活性位点残基盖、催化残基和2个天冬氨酸富集区,具有典型的多聚异戊二烯基合成酶活性结构域和鲨烯/八氢番茄红素合成酶活性结构域。分析结果可为SQS的酶学特性及三萜类化合物生物合成的分子机制研究提供理论基础。
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