| 罗氏沼虾转录组免疫相关SNP的挖掘与分析 |
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| 引用本文： | 唐修阳,王传聪,项杰,欧江涛,王资生.罗氏沼虾转录组免疫相关SNP的挖掘与分析[J].江苏农业科学,2019,47(4). |
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| 作者姓名： | 唐修阳 王传聪 项杰 欧江涛 王资生 |
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| 作者单位： | 盐城工学院海洋与生物工程学院,江苏盐城,224051;盐城工学院海洋与生物工程学院,江苏盐城,224051;盐城工学院海洋与生物工程学院,江苏盐城,224051;盐城工学院海洋与生物工程学院,江苏盐城,224051;盐城工学院海洋与生物工程学院,江苏盐城,224051 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金;国家自然科学基金;国家自然科学基金 |
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| 摘 要： | 为了挖掘罗氏沼虾免疫相关单核苷酸多态性(SNP),采用第二代高通量测序技术,对罗氏沼虾的肝胰腺进行转录组深度测序分析。结果发现SNP位点37 589个,其中转换25 188个,颠换12 401个。再对SNP所在的基因进行GO(gene ontology)分类和KOG注释,分别筛选到2 451个有GO注释和2 458个有KOG注释的SNP,并重点对4个重要免疫通路的145个免疫相关基因,筛选出129个SNP位点。相关研究结果将为进一步系统挖掘免疫相关SNP的分子遗传标记奠定基础,为罗氏沼虾疾病防控和选育抗病新品种提供科学参考。
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| 关 键 词： | 罗氏沼虾 转录组 SNP 高通量测序技术 免疫 抗病 |
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