| 猪单核源性巨噬细胞受FSL-1刺激后lncRNAs的鉴定与特征分析 |
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| 引用本文： | 赵为民,方晓敏,涂枫,周李生,李碧侠,王学敏,付言峰,任守文.猪单核源性巨噬细胞受FSL-1刺激后lncRNAs的鉴定与特征分析[J].江苏农业学报,2019(2). |
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| 作者姓名： | 赵为民 方晓敏 涂枫 周李生 李碧侠 王学敏 付言峰 任守文 |
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| 作者单位： | 江苏省农业科学院畜牧研究所/江苏省农业种质资源保护与利用平台;农业部种养结合重点实验室 |
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| 摘 要： | lncRNA是新近发现的一种具有重要功能的RNA分子,在各种生理活动中发挥着重要作用。为鉴定猪单核源性巨噬细胞受FSL-1刺激后相关的lncRNA,利用二代测序技术结合生物信息学对lncRNA进行了组装与特征分析。结果显示FSL-1刺激成功地构建了细胞炎症模型,试验组与对照组共鉴定到1 056个lncRNA转录本,其对应于831个基因座,这些lncRNA的平均长度为1 643 bp,平均外显子数为2.4个。相对于对照组,试验组有51个lncRNA上调表达,44个lncRNA下调表达。在上调lncRNA两侧相邻的蛋白质编码基因参与免疫反应、炎症反应、病毒反应等通路,而在下调lncRNA两侧相邻的蛋白质编码基因参与的通路较少,不参与上述通路。定量PCR结果显示挑选的4个lncRNA的差异倍数与RNA-Seq的结果相似,其中上调的lncRNA呈现一定的组织特异表达,而下调的lncRNA呈现多组织表达。这些结果为进一步研究lncRNA在FSL-1介导的炎症反应中的作用奠定了基础。
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| 本文献已被 CNKI 等数据库收录！ |
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