| 双亲本杂交衍生的多个相关群体QTL图的联合构建方法 |
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| 引用本文： | 敖 雁,胡治球,汤在祥,王学枫,徐辰武.双亲本杂交衍生的多个相关群体QTL图的联合构建方法[J].麦类作物学报,2009,29(4):553-558. |
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| 作者姓名： | 敖 雁 胡治球 汤在祥 王学枫 徐辰武 |
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| 作者单位： | 扬州大学江苏省作物遗传生理重点实验室,江苏扬州,225009 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金，扬州大学科技创新培育基金 |
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| 摘 要： | 为了研究双亲杂交衍生的多个群体QTL作图分析的方法,对两个亲本通过任意杂交设计衍生的任意多个相关群体联合分析的方法进行了探讨.其要点是:首先利用染色体上所有标记基因型联合计算该染色体上任一假定位置QTL的条件概率,然后根据混合分布理论建立基于EM算法实现的QTL作图的极大似然估计方法.以双亲杂交衍生的F2和BC群体联合分析为例,用计算机模拟数据研究了QTL遗传力和样本容量两个因素对方法的影响.结果表明,在染色体水平模拟时,相同的遗传力下,F2和BC群体联合分析的统计功效明显高于这两个群体单独分析的统计功效.此外,即使两个群体联合分析时的样本容量与两个群体单独分析时的样本容量相等,联合分析的统计功效亦明显高于单独分析的统计功效.且随着遗传力和样本容量的提高,本方法的统计功效逐步提高.在参数估计的准确度和精确度上,相同的遗传力下,F2和BC群体联合分析普遍高于这2个群体的单独分析,尤其是在低遗传力(5%)和较少样本容量下(50),这种优势更为明显.且随着遗传力和样本容量的提高,各参数估计的准确度和精确度亦逐步提高.为了验证本方法的效用,在全基因组水平进行了模拟分析,同样得到了预期的结果.
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| 关 键 词： | 双亲本杂交 相关群体 QTL作图 极大似然方法 |
QTL Mapping in Multiple Related Populations Derived from Two Parents |
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| AO Yan,HU Zhi qiu,TANG Zai xiang,WANG Xue feng,XU Chen wu.QTL Mapping in Multiple Related Populations Derived from Two Parents[J].Journal of Triticeae Crops,2009,29(4):553-558. |
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| Authors: | AO Yan HU Zhi qiu TANG Zai xiang WANG Xue feng XU Chen wu |
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| Institution: | Jiangsu Provincial Key Laboratory of Crop Genetics and Physiology;Yangzhou University;Yangzhou 225009;China |
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| Abstract: | Most of the current methods for QTL mapping are designed for the single segregation population derived from the cross of two inbred lines.Incorporating the existing populations derived from two parents may improve QTL mapping and QTL-based breeding programs.However,no general maximum likelihood method has been available for this strategy.In this paper,the general mapping method that can combine multiple related populations derived from two parents was proposed.Computer simulations were performed to validate... |
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| Keywords: | The cross of two inbred lines Related population QTL mapping Maximum likelihood estimation |
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