| 草菇α-淀粉酶基因的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 杜慕云,杨仁德,李剑,谢宝贵.草菇α-淀粉酶基因的生物信息学分析[J].食用菌学报,2014(3). |
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| 作者姓名： | 杜慕云 杨仁德 李剑 谢宝贵 |
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| 作者单位： | 1. 贵州省土壤肥料研究所，贵州贵阳 550009; 福建农林大学菌物研究中心，福建福州 350002
2. 贵州省土壤肥料研究所,贵州贵阳,550009
3. 福建农林大学菌物研究中心,福建福州,350002 |
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| 基金项目： | 草菇育种岗位，黔科合体( |
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| 摘 要： | 基于草菇(Volvariella volvacea)基因组和转录组数据,通过生物信息学的方法对草菇α-淀粉酶基因进行基本理化性质、内含子和外显子结构、信号肽、亚细胞定位和功能位点的预测与分析,并构建系统发育树。结果表明:编码草菇α-淀粉酶的基因有5个,分别为GME2151、GME6695、GME9075、GME10698和GME10705;5个基因编码的蛋白相对分子量介于38.8~64.6kD之间,磷酸化以Ser位点为主,大都存在信号肽,亚细胞定位在细胞外,保守结构域和空间结构相似度较高。和其它的担子菌一样,草菇α-淀粉酶可以分为两类:GME9075和GME10698归为α-淀粉酶Ⅰ类,GME2151、GME6695和GME10705属于α-淀粉酶Ⅱ类。
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| 关 键 词： | 草菇 α-淀粉酶基因 生物信息学 |
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