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利用简单重复序列(SSR)标记分析太湖稻区现代粳稻品种的遗传多样性
引用本文:罗兵,徐港明,孙海燕,杨志刚,沈宗根,高阳,王小虎,端木银熙.利用简单重复序列(SSR)标记分析太湖稻区现代粳稻品种的遗传多样性[J].农业生物技术学报,2014(12).
作者姓名:罗兵  徐港明  孙海燕  杨志刚  沈宗根  高阳  王小虎  端木银熙
作者单位:1. 常熟理工学院生物与食品工程学院,常熟215500; 国家杂交水稻工程技术研究中心常熟分中心,常熟215500
2. 常熟理工学院生物与食品工程学院,常熟,215500
3. 国家杂交水稻工程技术研究中心常熟分中心,常熟215500; 常熟市农业科学研究所,常熟215500
基金项目:江苏农业科技科技支撑项目,苏州市科技计划项目,江苏省大学生实践创新训练计划项目,苏州市吴江区科技计划项目,常熟市科技计划项目
摘    要:太湖地区有丰富的粳稻(Oryza satiua ssp.japonica)种植资源,随着品种大面积推广应用,育种材料的遗传基础趋窄,相似性增高,使粳稻育种突破困难。本研究利用分布于水稻(Oryza satiua L.)12条染色体上的24对简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)引物对太湖地区的42份粳稻品种进行遗传多样性分析。结果表明,有23对SSR引物在42份粳稻材料间表现出多态性;23对引物共检测到105个等位基因,每对SSR引物检测到等位基因为2~8个,平均为4.57个,有效等位基因共有56.43个,平均每个位点为2.45个。每个多态位点的多态信息含量(polymorphism information content,PIC)变幅为0.083 0~0.8079,平均为0.496 6;每个粳稻材料多态性位点数的变幅为6~19,等位基因总数的变幅为27~55;42份粳稻品种间的遗传相似系数变幅为0.391~0.990,平均为0.610,遗传相似系数在0.50~0.80之间的材料占全部的74.45%,供试材料相似度高;非加权配对算术平均法(unweighed pair group method with arithmetic mean;UPGMA)聚类结果显示,遗传相似系数为0.50,42份粳稻材料可以分为两个类群,一个类群包含19份常规粳稻,另一个类群包括其他23份杂交粳稻。结果显示,太湖地区的粳稻品种总体上遗传背景相似度高,遗传多样性不够丰富,育种工作有待进一步加强新的基因资源引进和利用,创新水稻育种材料。本研究结果为新品种选育提供技术支持和理论根据。

关 键 词:粳稻  简单重复序列(SSR)标记  遗传多样性

Genetic Diversity Analysis of Modern Japonica Rice (Oryza satiua L.) from Taihu Area Based on Simple Sequence Repeat (SSR) Markers
LUO Bing,XU Gang-Ming,SUN Hai-Yan,YANG Zhi-Gang,SHEN Zong-Gen,GAO Yang,WANG Xiao-Hu,DUANMU Yin-Xi.Genetic Diversity Analysis of Modern Japonica Rice (Oryza satiua L.) from Taihu Area Based on Simple Sequence Repeat (SSR) Markers[J].Journal of Agricultural Biotechnology,2014(12).
Authors:LUO Bing  XU Gang-Ming  SUN Hai-Yan  YANG Zhi-Gang  SHEN Zong-Gen  GAO Yang  WANG Xiao-Hu  DUANMU Yin-Xi
Abstract:
Keywords:Japonica rice  Simple sequence repeat (SSR) markers  Genetic diversity
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