| 新型鸭肝炎病毒GD1株VP1结构蛋白的基因分析及B细胞抗原表位预测 |
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| 引用本文： | 范卫国,杜佳慧,曹瑞兵,陈溥言.新型鸭肝炎病毒GD1株VP1结构蛋白的基因分析及B细胞抗原表位预测[J].畜牧与兽医,2011,43(1). |
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| 作者姓名： | 范卫国 杜佳慧 曹瑞兵 陈溥言 |
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| 作者单位： | 南京农业大学动物医学院,江苏,南京,210095 |
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| 基金项目： | 国家大学生创新性实验计划 |
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| 摘 要： | 对新型鸭肝炎病毒(DHV)GD1株VP1结构蛋白基因进行了扩增、克隆及序列测定。采用DNAStar Protean软件对VP1蛋白的二级结构、可塑性、亲水性、表面可能性及抗原指数等参数进行分析,综合预测其B细胞表位分布。结果表明,VP1基因长720 bp,编码240个氨基酸。与国内和韩国分离的新型毒株的氨基酸序列相似性最高,分别为99.6%,92.9%和92.5%。与台湾新型DHV的序列相似性均较低,分别为80.6%,80.2%,与传统的Ⅰ型DHV毒株的序列相似性最低,相似度仅为25.5%。较1型DHV存在多个氨基酸的插入和较多氨基酸位点的突变,高变区主要集中在180～220位。VP1结构蛋白的二级结构较为复杂,含有较多的β片层结构和转角结构,有多个区域为B细胞优势表位。该方法预测的B细胞表位结果有较高的准确度,为试验确定新型DHV毒株的VP1结构蛋白的B细胞表位和新的多表位疫苗设计提供了理论基础。
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| 关 键 词： | 新型鸭肝炎病毒 VP1蛋白 序列分析 B细胞表位 |
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