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| 翦股颖EST-SSR信息分析与分子标记开发 | |
| 引用本文： | 赵岩,王涛,孔凡美,李斯深.翦股颖EST-SSR信息分析与分子标记开发[J].中国草地学报,2010,32(4). |
| 作者姓名： | 赵岩 王涛 孔凡美 李斯深 |
| 作者单位： | 1. 作物生物学国家重点实验室/山东农业大学农学院,山东,泰安,271018;山东农业大学资源与环境学院,山东,泰安,271018 2. 山东农业大学资源与环境学院,山东,泰安,271018 3. 作物生物学国家重点实验室/山东农业大学农学院,山东,泰安,271018 |
| 基金项目： | 农大肥业科研基金，科技支疆计划，国家自然科学基金 |
| 摘 要： | 为加速分子标记在翦股颖中的应用,利用GenBank中翦股颖EST数据信息,展开了翦股颖EST-SSR信息分析和标记开发研究。在16992条翦股颖EST序列中,共发现微卫星序列254条,占整个EST总数的1.49%。EST序列总长为12717kb,平均每50.07kb含有1个SSR。EST-SSR分布特征分析表明,在所有SSR中,六核苷酸基序最多(37.80%),三核苷酸基序(31.10%)次之;六核苷酸基序以TGCGGC/ACGCCG出现频率最高(3.15%),TCCAGC/AGGTCG次之(2.36%);三核苷酸基序以CAG/GTC出现频率最高(10.63%),其次分别为GCA/CGT(3.54%)、GAT/CTA(2.36%)和AAG/TTC(2.36%)。根据这些含有SSR的EST序列,利用Pri mer 5.0软件,设计了77对EST-SSR引物,并选择其中15对引物进行合成。15对引物在翦股颖中均有PCR扩增条带。利用这些引物,选用8个翦股颖品种进行多态性研究,其中9对EST-SSR引物有多态性,共检测到23个多态性位点,平均每对引物产生2.56个多态性位点。 |
| 关 键 词： | 翦股颖 标记开发 |
Information Analysis and Molecular Marker Exploitation of EST-SSR in Bentgrasses (Agrostis L.) |
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| ZHAO Yan,WANG Tao,KONG Fan-mei,LI Si-shen.Information Analysis and Molecular Marker Exploitation of EST-SSR in Bentgrasses (Agrostis L.)[J].Chinese Journal of Grassland,2010,32(4). | |
| Authors: | ZHAO Yan WANG Tao KONG Fan-mei LI Si-shen |
| Abstract: | |
| Keywords: | EST-SSR |
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