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香鱼抗凝血酶基因(AT)cDNA的克隆、序列分析及组织表达特征
引用本文:李长红,陈炯,史雨红,陆新江.香鱼抗凝血酶基因(AT)cDNA的克隆、序列分析及组织表达特征[J].农业生物技术学报,2011,19(1).
作者姓名:李长红  陈炯  史雨红  陆新江
作者单位:宁波大学应用海洋生物技术教育部重点实验室,宁波,315211
基金项目:长江学者和创新团队发展计划(No.IRT0734); 高等学校博士学科点专项科研基金(No.20093305110001)资助
摘    要:抗凝血酶(antithrombin,AT)主要抑制凝血酶(thrombin)及其它凝血因子的活性,并具有重要的抗炎活性。本实验从香鱼(Plecoglossus altivelis)肝组织cDNA文库中成功获得了香鱼AT基因的cDNA全序列(EMBL登录号:FN429980)。测序结果表明,香鱼AT基因cDNA全长1487个核苷酸,包含1个大的开放阅读框(ORF),推测编码1个由453个氨基酸组成的蛋白,N端23个氨基酸为信号肽序列。成熟AT具有与哺乳动物AT相似的特征结构,包括:羧基末端附近的丝氨酸蛋白酶活性中心、6个保守的Cys残基形成的3个二硫键结构和4个N-糖基化位点。氨基酸序列分析表明,香鱼AT与大西洋鲑(Salmo salar)AT氨基酸序列同源性最高,为81%。系统进化树分析表明,物种AT的进化关系与目前接受的物种分类关系基本一致,香鱼AT位于鱼类AT簇中,与大西洋鲑、红鳍东方豚(Takifugu rubripes)和斑马鱼(Danio rerio)AT进化相关性最高。AT mRNA在健康香鱼的肝组织中表达量最大,在脾、肾和脑中表达量较低。实时荧光定量PCR结果表明,在鳗利斯顿氏菌(Listone...

关 键 词:抗凝血酶  克隆  序列分析  组织表达特征  实时荧光定量PCR  

Cloning, Sequence Analysis and mRNA Expression Pattern of Antithrombin Gene(A T) in Ayu(Plecoglossus altivelis)
Li Changhong,Chen Jiong,Shi Yuhong,Lu Xinjiang.Cloning, Sequence Analysis and mRNA Expression Pattern of Antithrombin Gene(A T) in Ayu(Plecoglossus altivelis)[J].Journal of Agricultural Biotechnology,2011,19(1).
Authors:Li Changhong  Chen Jiong  Shi Yuhong  Lu Xinjiang
Institution:Li Changhong Chen Jiong Shi Yuhong Lu Xinjiang Key Laboratory of Applied Marine Biotechnology,Ministry of Education,Ningbo University,Ningbo 315211,China
Abstract:Antithrombin(AT) is the major inhibitor of thrombin and other serine proteinases comprising the coagulation cascade enzymes. Furthermore,it has anti-inflammatory properties. The nucleotide sequence of full-length cDNA clone of ayu(Plecoglossus altivelis) AT gene (EMBL accession:No. FN429980) was obtained from the constructed liver cDNA of ayu. The whole cDNA length of ayu AT gene was 1 487 bp,consisting of a 1 362 bp open reading frame(ORF). The predicted mature ayu AT consisted of 453 amino acids preceded ...
Keywords:Antithrombin  Clone  Sequence analysis  mRNA expression pattern  Quantitative real-time PCR(qRT-PCR)  
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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