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柑橘溃疡病菌LAMP实时浊度检测方法的建立及应用
引用本文:封立平,孔德英,孙涛,孙冬,纪瑛,王简.柑橘溃疡病菌LAMP实时浊度检测方法的建立及应用[J].热带作物学报,2015,36(6):1153-1160.
作者姓名:封立平  孔德英  孙涛  孙冬  纪瑛  王简
作者单位:山东出入境检验检疫局检验检疫技术中心;重庆出入境检验检疫局检验检疫技术中心;重庆出入境检验检疫局检验检疫技术中心;山东出入境检验检疫局检验检疫技术中心;山东出入境检验检疫局检验检疫技术中心;山东出入境检验检疫局检验检疫技术中心
基金项目:质检总局科研项目(No. 2009IK254,2011IK186,2011IK286),“十二五”国家科技支撑计划课题(No. 2012BAK11B02)。
摘    要:以柑橘溃疡病菌特异性高的假定蛋白基因(登录号:AE008923.1)为靶标,设计并筛选4条引物来特异性识别靶标序列中的6个独立区域,建立柑橘溃疡病菌LAMP实时浊度检测方法。该方法利用实时浊度仪检测反应过程中产生的焦磷酸镁白色沉淀,实现对LAMP整个反应过程的实时监控。从镁离子浓度、甜菜碱浓度、dNTPs浓度、引物浓度和反应温度5个变量参数对 LAMP检测体系进行优化,并对方法的特异性、灵敏度、稳定性及实际样品检测效果进行评价。结果显示,该体系经优化后稳定性良好,可在66 ℃ 恒温条件下,60 min内完成检测;DNA检测下限可达0.02 ng/μL,灵敏度与荧光定量PCR方法相同,比常规PCR方法高1个数量级;能快速、准确地对田间疑似样品进行检测,与荧光定量PCR方法的检出情况一致,没有漏检。结果说明柑橘溃疡病菌实时浊度LAMP检测方法操作简便、所需时间短,特异性与灵敏度高,为柑橘溃疡病菌的快速筛查提供较好的途径。

关 键 词:LAMP实时浊度检测方法  柑橘溃疡病菌  检测

Rapid Detection of Xanthomonas axonopodis pv. Citri by LAMP Real-time Turbidity Method
FENG Liping,KONG Deyin,SUN Tao,SUN Dong,JI Ying and WANG Jian.Rapid Detection of Xanthomonas axonopodis pv. Citri by LAMP Real-time Turbidity Method[J].Chinese Journal of Tropical Crops,2015,36(6):1153-1160.
Authors:FENG Liping  KONG Deyin  SUN Tao  SUN Dong  JI Ying and WANG Jian
Institution:Technical Center, Shandong Entry-Exit Inspection and Quarantine Bureau;Technical Center, Chongqing Entry-Exit Inspection and Quarantine Bureau;Technical Center, Chongqing Entry-Exit Inspection and Quarantine Bureau;Technical Center, Shandong Entry-Exit Inspection and Quarantine Bureau;Technical Center, Shandong Entry-Exit Inspection and Quarantine Bureau;Technical Center, Shandong Entry-Exit Inspection and Quarantine Bureau
Abstract:
Keywords:LAMP real-time turbidity method  Xanthomonas axonopodis pv  citri  Detection
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