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马尾松PmTIR1基因的克隆及编码蛋白质的结构预测
引用本文:苏江,郭天玮,季孔庶.马尾松PmTIR1基因的克隆及编码蛋白质的结构预测[J].分子植物育种,2015(6).
作者姓名:苏江  郭天玮  季孔庶
作者单位:南京林业大学南方现代林业协同创新中心,南京,210037
基金项目:国家“十二五”科技支撑项目,林业公益性行业科研专项经费,江苏高校优势学科建设工程项目,南方现代林业协同创新项目共同资助
摘    要:TIR1(transport inhibitor response 1)基因在生长素信号转导途径中发挥重要作用。本研究采用PCR技术和RACE技术,利用Primer Premier5进行引物设计,从马尾松中克隆出TIR1基因的全长c DNA序列,命名为Pm TIR1。此c DNA全长2 446 bp,包括1 725 bp完整的ORF,能够编码含有574个氨基酸的蛋白,此蛋白相对分子质量为64 240.3 u,等电点为6.76。利用Clustal X、ANTHEPROT和DNAMAN等软件分析Pm TIR1序列及其编码的氨基酸序列,结果表明:马尾松Pm TIR1蛋白氨基酸序列与火距松TIR1蛋白同源性高达99%,Pm TIR1蛋白含有F-box结构域和多个LRR结构域;Pm TIR1蛋白的F-box结构域可能与SCFTIR1中SKP1结合,它符合F-box家族的特点。利用实时定量技术得知Pm TIR1在马尾松嫩根、嫩茎、嫩叶中都有表达,在嫩叶中表达量最高、嫩根中次之、嫩茎中最低。本研究可为生长素调控马尾松生长发育相关机理提供理论依据。

关 键 词:马尾松  生长素  TIR1  (transport  inhibitor  response  1)  序列分析  结构预测

Cloning and Coding Protein Structure Prediction of TIR 1 Gene from Pinus mas s oniana
Su Jiang,Guo Tianwei,Ji Kongshu.Cloning and Coding Protein Structure Prediction of TIR 1 Gene from Pinus mas s oniana[J].Molecular Plant Breeding,2015(6).
Authors:Su Jiang  Guo Tianwei  Ji Kongshu
Abstract:
Keywords:Pinus massoniana  Auxin  TIR1 (transport inhibitor response 1)  Sequence analysis  Structure predi-ction
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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