| 盐胁迫下不同甘薯品种的转录组测序分析 |
| |
| 引用本文： | 张小红,彭琼,鄢铮.盐胁迫下不同甘薯品种的转录组测序分析[J].作物学报,2023(5):1432-1444. |
| |
| 作者姓名： | 张小红 彭琼 鄢铮 |
| |
| 作者单位： | 福州市农业科学研究所 |
| |
| 摘 要： | 为了获得甘薯耐盐转录组序列信息,挖掘差异表达基因及其相关代谢途径,本文以盐胁迫处理0 d、3 d和6d的耐盐甘薯品种‘榕薯819’以及不耐盐甘薯品种‘榕薯910’的叶片为材料,借助高通量测序技术进行转录组测序分析。结果表明, 2个品种共获得157,252条Unigenes,平均组装长度为576 bp。其中有83,264条Unigenes在七大数据库中得到注释,占总数的52.95%。NR注释分类结果显示,在牵牛花(Ipomoea nil)中比对到同源序列的Unigenes最多,共43,620条,占总数的57.05%。Unigenes在KOG数据库中的注释主要富集在普通功能预测(8752个)、信号转导机制(5067个)以及翻译后修饰、蛋白转换、分子伴侣(4471个)中。差异表达分析显示,在‘榕薯819’中,盐处理3 d和6d的样品差异表达基因数分别为323个和3752个,共参与了33个GO功能分类项和302条KEGG代谢通路。在‘榕薯910’中,差异表达基因数则分别为5554个和7395个,共参与了50个GO功能分类项,涉及了329条KEGG代谢通路。以部分差异表达基因的转录组数据为基础,...
|
| 关 键 词： | 甘薯 盐胁迫 转录组 高通量测序 |
|
|
