| 基于高深度基因组重测序的‘铁观音’茶树无性繁殖后代遗传变异研究 |
| |
| 引用本文： | 侯炳豪,高婷,魏月德,高水练,蔡银笔,陈志明,金珊,张兴坦,王鹏杰,叶乃兴.基于高深度基因组重测序的‘铁观音’茶树无性繁殖后代遗传变异研究[J].园艺学报,2023(7):1505-1517. |
| |
| 作者姓名： | 侯炳豪 高婷 魏月德 高水练 蔡银笔 陈志明 金珊 张兴坦 王鹏杰 叶乃兴 |
| |
| 作者单位： | 1. 福建农林大学园艺学院,茶学福建省高校重点实验室;2. 福建安溪岐山魏荫名茶有限公司;3. 福建八马茶业有限公司;5. 中国农业科学院农业基因组研究所 |
| |
| 摘 要： | 对茶树Camelliasinensis(L.)O.Kuntze]‘铁观音’母树及其连续3代无性繁殖后代和3个经多代无性繁殖的生产茶园叶片进行超过50×的高深度基因组重测序。通过SNP和InDel检测与注释，发现大部分变异位于基因间区，只有1.09%～1.13%的SNP和0.51%～0.61%的InDel位于基因编码区。在全基因组和编码区范围内，连续3代无性繁殖后代的样本之间总变异位点数均差别不大，各样本中涉及突变的基因数基本一致，推测‘铁观音’品种的种性在无性繁殖过程中总体保持稳定。与母树间差异基因的KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)富集结果表明，生产茶园样本在嘌呤类和糖类代谢通路中显著富集，并在咖啡碱代谢通路中呈极显著富集，推测‘铁观音’品种在长时间无性繁殖过程中，部分与品质相关的代谢通路基因发生变化。与前3代样本相比，FAR1、WAT1和MYB等3个与生长发育相关，PP2A、BTB/POZ、BAT2、RPP13和Lr10等5个与逆境响应相关的基因序列在生产茶园样本中发生了变异。
|
| 关 键 词： | 茶树 无性繁殖 重测序 遗传变异 |
|
|
